More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3816 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  87.78 
 
 
404 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  97.49 
 
 
399 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  100 
 
 
399 aa  790    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  58.69 
 
 
410 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  57.88 
 
 
393 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  57.88 
 
 
393 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  58.12 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  55.56 
 
 
395 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  54.01 
 
 
402 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  48.89 
 
 
398 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.63 
 
 
411 aa  335  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  51.15 
 
 
400 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  48.74 
 
 
405 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  51.15 
 
 
392 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  49.12 
 
 
396 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.27 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  49.75 
 
 
401 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  49.87 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  50.65 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.77 
 
 
402 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  47 
 
 
397 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  50.25 
 
 
400 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  50.37 
 
 
416 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  50.25 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  50.25 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  47.62 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.52 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  50 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  50 
 
 
392 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  50 
 
 
392 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  50 
 
 
392 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  48.84 
 
 
389 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  46.46 
 
 
394 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  48.57 
 
 
382 aa  315  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  48.87 
 
 
389 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  46.27 
 
 
393 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.37 
 
 
407 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  48.15 
 
 
1305 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  46.87 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  46.45 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  48.38 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  45.52 
 
 
400 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  47.49 
 
 
398 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.19 
 
 
392 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.59 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  49.12 
 
 
391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  45.78 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  45.76 
 
 
396 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  49.01 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  48.94 
 
 
371 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  45.45 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  45.61 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  47.79 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  46.62 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  45.95 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.12 
 
 
402 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  44.74 
 
 
408 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  45.41 
 
 
404 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  48.4 
 
 
371 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  44.91 
 
 
405 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.06 
 
 
396 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.8 
 
 
396 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  46 
 
 
400 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.07 
 
 
403 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  45.5 
 
 
391 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.4 
 
 
408 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  44.25 
 
 
403 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.27 
 
 
396 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  41.22 
 
 
401 aa  289  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.89 
 
 
397 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  44.5 
 
 
405 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  46.48 
 
 
392 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  43.8 
 
 
412 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  41.21 
 
 
399 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  48.37 
 
 
402 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  48.37 
 
 
402 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  45.75 
 
 
400 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  44.33 
 
 
385 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  43.26 
 
 
396 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  39.02 
 
 
405 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  44.09 
 
 
397 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  45.82 
 
 
394 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  46.33 
 
 
1230 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.1 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  47.04 
 
 
1228 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  38.46 
 
 
405 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  42.01 
 
 
393 aa  269  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  40.97 
 
 
401 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  35.48 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  45.98 
 
 
1230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  36.11 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.31 
 
 
405 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  39.29 
 
 
593 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  42.86 
 
 
407 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  41.18 
 
 
394 aa  256  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  35.35 
 
 
398 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  38.75 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  34.18 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  35.77 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  33.5 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>