More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3796 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  99.3 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  90.91 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  90.91 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  90.21 
 
 		 143 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  86.71 
 
 		 143 aa  253  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  86.62 
 
 		 143 aa  251  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  64.79 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  64.08 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  64.08 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  63.38 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  63.38 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  64.08 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  63.38 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  61.97 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  61.97 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  61.97 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  46.48 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  44.37 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  43.66 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  45.04 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  44.92 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  49.15 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  43.22 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  45.9 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  43.33 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  40.17 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  40.14 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  38.85 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  36.5 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  37.19 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  37.19 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  43.66 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  34.29 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.53 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.04 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  38.83 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.59 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  31.69 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.61 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.88 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.16 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  40.34 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.61 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  39.53 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  35 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.83 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.34 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.13 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  35 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  39.66 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  34.45 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  33.6 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  37.93 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.02 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  32.43 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  31.36 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  27.59 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 618 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.57 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 859 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.17 
 
 		 883 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>