More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3770 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  65.62 
 
 		 846 aa  899    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  99.03 
 
 		 857 aa  1539    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  66.87 
 
 		 821 aa  1111    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  65.28 
 
 		 810 aa  915    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  70.8 
 
 		 698 aa  1001    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  71.74 
 
 		 850 aa  1034    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  65.04 
 
 		 846 aa  915    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  71.49 
 
 		 742 aa  1046    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  90.89 
 
 		 862 aa  1460    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  90.79 
 
 		 858 aa  1425    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  76.67 
 
 		 844 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  79.23 
 
 		 787 aa  1097    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  73.42 
 
 		 834 aa  1090    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  59.57 
 
 		 678 aa  770    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  57.04 
 
 		 675 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  64.76 
 
 		 801 aa  904    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  73.92 
 
 		 838 aa  1115    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  72.16 
 
 		 787 aa  1051    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  70.53 
 
 		 826 aa  1023    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  65.49 
 
 		 846 aa  919    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  73.28 
 
 		 732 aa  1026    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  72.05 
 
 		 743 aa  1055    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  90.89 
 
 		 857 aa  1435    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  88.62 
 
 		 888 aa  1337    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  62.81 
 
 		 841 aa  906    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  72.19 
 
 		 743 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 870 aa  1765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  72.85 
 
 		 728 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  58.85 
 
 		 686 aa  797    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  90.89 
 
 		 857 aa  1435    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  72.05 
 
 		 743 aa  1055    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  49.85 
 
 		 783 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.57 
 
 		 743 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  39.12 
 
 		 850 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.27 
 
 		 750 aa  452  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.73 
 
 		 730 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 		 774 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  39.34 
 
 		 762 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 752 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 755 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.86 
 
 		 760 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.73 
 
 		 854 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.17 
 
 		 740 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.5 
 
 		 815 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.02 
 
 		 786 aa  412  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.38 
 
 		 786 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.38 
 
 		 762 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 768 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.28 
 
 		 759 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.4 
 
 		 794 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  34.98 
 
 		 772 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.19 
 
 		 765 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.42 
 
 		 785 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.06 
 
 		 767 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.4 
 
 		 907 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.53 
 
 		 776 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  30.01 
 
 		 823 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  30.15 
 
 		 823 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.96 
 
 		 648 aa  301  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  31.84 
 
 		 790 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.94 
 
 		 679 aa  298  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 		 681 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.88 
 
 		 683 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.59 
 
 		 761 aa  291  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  31.02 
 
 		 833 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 805 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.02 
 
 		 707 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 810 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  29.62 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  32.24 
 
 		 850 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 625 aa  284  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  31.66 
 
 		 807 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 709 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  32.08 
 
 		 850 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  30.61 
 
 		 773 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.49 
 
 		 648 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  32.08 
 
 		 850 aa  284  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 		 713 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 		 713 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.07 
 
 		 713 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  32.08 
 
 		 850 aa  283  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  30.26 
 
 		 803 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 709 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 709 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  29.83 
 
 		 804 aa  282  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  31.91 
 
 		 850 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  32.16 
 
 		 773 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.7 
 
 		 748 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  32.19 
 
 		 850 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  32.19 
 
 		 850 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  30.19 
 
 		 794 aa  281  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 		 646 aa  281  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 804 aa  281  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  32.19 
 
 		 850 aa  281  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 713 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 713 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 713 aa  281  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>