More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3594 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  98.42 
 
 
316 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  92.41 
 
 
316 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  92.41 
 
 
316 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  92.41 
 
 
316 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  91.69 
 
 
314 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  90.82 
 
 
316 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  86.08 
 
 
513 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  86.08 
 
 
310 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  86.08 
 
 
308 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  86.08 
 
 
308 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  86.08 
 
 
308 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  85.76 
 
 
308 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  83.12 
 
 
308 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  80.38 
 
 
308 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  79.75 
 
 
308 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  80.74 
 
 
300 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  80.74 
 
 
300 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  76.63 
 
 
322 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  75.76 
 
 
304 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  75.43 
 
 
304 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  75.43 
 
 
304 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  73.15 
 
 
338 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  74.11 
 
 
307 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  75.69 
 
 
306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  76.04 
 
 
309 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  75.26 
 
 
305 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  76.12 
 
 
304 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  76.12 
 
 
304 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  71.61 
 
 
305 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  78.99 
 
 
305 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  71.43 
 
 
307 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  68.85 
 
 
324 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  79.38 
 
 
316 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  69.41 
 
 
310 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  68.32 
 
 
324 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  69.28 
 
 
337 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  69.46 
 
 
359 aa  428  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  72.73 
 
 
310 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  68.97 
 
 
301 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  70 
 
 
304 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  70 
 
 
304 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  79.13 
 
 
305 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  62.46 
 
 
305 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  64.51 
 
 
302 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  61.39 
 
 
306 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  66.54 
 
 
258 aa  352  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  63.78 
 
 
288 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  65.45 
 
 
256 aa  346  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  65.57 
 
 
258 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  63.14 
 
 
320 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  56.7 
 
 
309 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  62.25 
 
 
305 aa  324  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  61.3 
 
 
280 aa  325  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  56.2 
 
 
318 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  61.15 
 
 
276 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  53.76 
 
 
292 aa  321  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  59.92 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  58.73 
 
 
281 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  60.56 
 
 
295 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  59.6 
 
 
285 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  55.64 
 
 
283 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  54.33 
 
 
280 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  62.67 
 
 
310 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  51.04 
 
 
393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 
280 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  51.66 
 
 
279 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  54.17 
 
 
271 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  61.09 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  54.55 
 
 
274 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  52.78 
 
 
285 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  61.16 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  58.04 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  56.47 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  54.39 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  54.39 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  54.66 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  55.79 
 
 
273 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  56.3 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  54.86 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  59.91 
 
 
367 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  56.36 
 
 
301 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  52.26 
 
 
304 aa  281  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  53.31 
 
 
270 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  54.36 
 
 
276 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  62.86 
 
 
296 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  51.14 
 
 
277 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  52.4 
 
 
278 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  53.75 
 
 
274 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  53.97 
 
 
272 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  58.93 
 
 
338 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  59.38 
 
 
324 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  53.97 
 
 
271 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  58.4 
 
 
318 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  53.97 
 
 
271 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  58.37 
 
 
391 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  52.61 
 
 
272 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  58.67 
 
 
316 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  58.37 
 
 
329 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  59.28 
 
 
365 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>