More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3527 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  88.51 
 
 
383 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  90.34 
 
 
383 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  91.12 
 
 
383 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  98.69 
 
 
383 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  90.34 
 
 
383 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  100 
 
 
408 aa  809    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  36.36 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  40.55 
 
 
362 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  32.8 
 
 
362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  32.08 
 
 
713 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  30.77 
 
 
380 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  34.29 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  28.57 
 
 
799 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  32.41 
 
 
339 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  31.22 
 
 
372 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  31.87 
 
 
690 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.58 
 
 
350 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  28.85 
 
 
715 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.61 
 
 
656 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  29.29 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  29.73 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  29.84 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  36.21 
 
 
685 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.64 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.98 
 
 
667 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  29.57 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  31.68 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.8 
 
 
660 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.83 
 
 
671 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  37.29 
 
 
777 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.52 
 
 
675 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  28.31 
 
 
405 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.85 
 
 
716 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  27.61 
 
 
604 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  27.61 
 
 
604 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.61 
 
 
662 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  26.27 
 
 
640 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  39.39 
 
 
711 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.65 
 
 
656 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  28.3 
 
 
643 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  28.68 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.29 
 
 
366 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  41.72 
 
 
377 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  28.88 
 
 
632 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  30.33 
 
 
641 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.08 
 
 
671 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.8 
 
 
660 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  29.27 
 
 
673 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.88 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.81 
 
 
682 aa  87.8  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30 
 
 
695 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  27.95 
 
 
607 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.31 
 
 
675 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  24.55 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  30.54 
 
 
635 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  27.87 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  28.47 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  27.87 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  30 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  37.43 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  28.47 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  28.46 
 
 
675 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  29.48 
 
 
688 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29.94 
 
 
679 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  29.29 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  30.03 
 
 
665 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  28.21 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.78 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.55 
 
 
645 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.23 
 
 
671 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  28.16 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.95 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.92 
 
 
681 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  25.34 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.08 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  39.41 
 
 
656 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  29.29 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  25.97 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  28.53 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  39.43 
 
 
726 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.09 
 
 
583 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  39.43 
 
 
726 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  39.43 
 
 
726 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  27.45 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  36.59 
 
 
710 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.11 
 
 
622 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  36.59 
 
 
710 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.14 
 
 
639 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  30.3 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.95 
 
 
629 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  38.01 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  37.02 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  40.99 
 
 
632 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  28.92 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.3 
 
 
684 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  28.57 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  28.83 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  34.2 
 
 
734 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  34.36 
 
 
602 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  29.91 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>