More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3473 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  60.65 
 
 		 885 aa  1014    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  44.1 
 
 		 882 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  58.26 
 
 		 886 aa  882    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  44.66 
 
 		 881 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  64.22 
 
 		 879 aa  1085    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  50.06 
 
 		 878 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.86 
 
 		 888 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  50.63 
 
 		 882 aa  763    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0335  chaperone clpB  79.8 
 
 		 975 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  48.57 
 
 		 909 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  50.56 
 
 		 905 aa  754    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  51.78 
 
 		 889 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  63.99 
 
 		 879 aa  1083    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  43.27 
 
 		 882 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  45.81 
 
 		 862 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  51.42 
 
 		 897 aa  759    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.74 
 
 		 884 aa  905    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  53.66 
 
 		 901 aa  855    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  50.17 
 
 		 865 aa  775    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  42.25 
 
 		 894 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  49.48 
 
 		 867 aa  767    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  48.77 
 
 		 899 aa  754    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.97 
 
 		 888 aa  914    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  50.23 
 
 		 849 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  49.37 
 
 		 898 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  82.91 
 
 		 893 aa  1407    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  44.89 
 
 		 913 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50.17 
 
 		 910 aa  749    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  64.22 
 
 		 879 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  60.65 
 
 		 885 aa  1014    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  45.81 
 
 		 867 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  52 
 
 		 889 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  58.74 
 
 		 888 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  76.32 
 
 		 918 aa  1305    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1696  SciG protein  79.6 
 
 		 975 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  63.99 
 
 		 887 aa  1083    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  48.78 
 
 		 846 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  51.89 
 
 		 889 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  43.33 
 
 		 885 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  51.25 
 
 		 889 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  46.23 
 
 		 899 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  50.8 
 
 		 889 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  51.05 
 
 		 889 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  81.92 
 
 		 893 aa  1447    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  57.79 
 
 		 887 aa  915    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  51.95 
 
 		 889 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  54.69 
 
 		 908 aa  881    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.62 
 
 		 904 aa  819    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.77 
 
 		 882 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  76.89 
 
 		 918 aa  1305    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  58.45 
 
 		 885 aa  899    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  42.91 
 
 		 872 aa  669    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  51.02 
 
 		 889 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  50.75 
 
 		 887 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  76.72 
 
 		 895 aa  1290    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  50.92 
 
 		 865 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  77.65 
 
 		 889 aa  1314    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  44.37 
 
 		 897 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.23 
 
 		 880 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.63 
 
 		 884 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  79.33 
 
 		 916 aa  1346    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  60.3 
 
 		 891 aa  1006    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  77.07 
 
 		 895 aa  1291    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  51.89 
 
 		 889 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  49.27 
 
 		 889 aa  761    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  43.47 
 
 		 893 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  55.67 
 
 		 900 aa  931    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.02 
 
 		 884 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  53.52 
 
 		 903 aa  842    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  51.89 
 
 		 889 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  50.86 
 
 		 842 aa  699    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  57.54 
 
 		 681 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  44.1 
 
 		 880 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  50.29 
 
 		 865 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  79.21 
 
 		 887 aa  1324    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  77.63 
 
 		 906 aa  1350    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  41.4 
 
 		 873 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  45.92 
 
 		 868 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0244  chaperone clpB  79.39 
 
 		 979 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  51.51 
 
 		 889 aa  769    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  42.54 
 
 		 884 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  100 
 
 		 897 aa  1793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  54.78 
 
 		 902 aa  935    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  49.48 
 
 		 849 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  44.42 
 
 		 877 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  55.11 
 
 		 887 aa  895    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  51.63 
 
 		 889 aa  766    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  43.99 
 
 		 880 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  79.32 
 
 		 906 aa  1356    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  52.06 
 
 		 915 aa  788    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  55.15 
 
 		 902 aa  935    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  51.4 
 
 		 889 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.39 
 
 		 895 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  54.21 
 
 		 916 aa  919    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.51 
 
 		 884 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  45.89 
 
 		 902 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  50 
 
 		 891 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.74 
 
 		 884 aa  905    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  51.42 
 
 		 897 aa  759    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  58.21 
 
 		 928 aa  943    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>