175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3469 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  61.05 
 
 		 626 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  56.85 
 
 		 628 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1024    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  52.92 
 
 		 637 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  61.15 
 
 		 627 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  61.37 
 
 		 626 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  80.38 
 
 		 629 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  61.15 
 
 		 627 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  61.46 
 
 		 627 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  86.96 
 
 		 629 aa  1125    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  86.8 
 
 		 629 aa  1135    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  61.21 
 
 		 639 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  60.25 
 
 		 626 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  60.89 
 
 		 626 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  54.29 
 
 		 626 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  60.86 
 
 		 654 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  71.22 
 
 		 630 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  67.36 
 
 		 629 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  54.29 
 
 		 626 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1279    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  64.71 
 
 		 626 aa  853    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1024    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  54.89 
 
 		 633 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  53.92 
 
 		 642 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1024    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  61.43 
 
 		 626 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  80.54 
 
 		 629 aa  1026    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  71.18 
 
 		 629 aa  931    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  54.29 
 
 		 626 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  61.37 
 
 		 626 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  74.68 
 
 		 629 aa  969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  80.38 
 
 		 629 aa  1024    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.98 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  48.57 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  48.57 
 
 		 623 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  48.57 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  48.57 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  48.41 
 
 		 623 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  48.57 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  48.25 
 
 		 623 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  48.41 
 
 		 623 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  47.37 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  47.07 
 
 		 620 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  44.79 
 
 		 628 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  43.88 
 
 		 624 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  44.66 
 
 		 624 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.38 
 
 		 624 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  43.02 
 
 		 619 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  43.02 
 
 		 619 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  43.58 
 
 		 619 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  43.04 
 
 		 641 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.87 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  39.87 
 
 		 625 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  41.46 
 
 		 638 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.72 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.47 
 
 		 652 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  33.9 
 
 		 605 aa  297  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.7 
 
 		 611 aa  293  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  31.7 
 
 		 606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.29 
 
 		 590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.22 
 
 		 610 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.76 
 
 		 606 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.02 
 
 		 590 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30.6 
 
 		 606 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  34.68 
 
 		 621 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30.61 
 
 		 606 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.07 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  32.65 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  32.65 
 
 		 611 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.84 
 
 		 621 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  32.65 
 
 		 611 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  32.65 
 
 		 611 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  32.65 
 
 		 611 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  32.49 
 
 		 611 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.54 
 
 		 589 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  32.39 
 
 		 616 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  32.17 
 
 		 611 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  32.87 
 
 		 620 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  31.3 
 
 		 589 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31.49 
 
 		 612 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31.49 
 
 		 612 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  31.01 
 
 		 612 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.36 
 
 		 612 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31.33 
 
 		 612 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31.33 
 
 		 612 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  31.42 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.24 
 
 		 593 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  29.24 
 
 		 609 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  31.41 
 
 		 597 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  30.82 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.45 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.15 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  29.89 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  29.89 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  27.22 
 
 		 614 aa  220  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  27.22 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  28.66 
 
 		 589 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  27.22 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>