More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3436 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  98.06 
 
 
519 aa  964  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  92.8 
 
 
523 aa  746  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  77.54 
 
 
553 aa  645  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.74 
 
 
587 aa  645  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  100 
 
 
518 aa  990  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  77.23 
 
 
582 aa  652  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  66.32 
 
 
521 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  67.45 
 
 
532 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  57 
 
 
514 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.89 
 
 
504 aa  406  1e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  48.94 
 
 
510 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  72.73 
 
 
334 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  72.73 
 
 
334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  72.73 
 
 
334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
511 aa  322  9e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 
522 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 
469 aa  241  3e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  38.5 
 
 
506 aa  236  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
522 aa  233  4e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
574 aa  231  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  36.43 
 
 
512 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 
516 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  36.21 
 
 
512 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  36.52 
 
 
512 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  36.04 
 
 
512 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 
478 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  35.81 
 
 
519 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  35.71 
 
 
512 aa  220  4e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  35.71 
 
 
512 aa  219  8e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  35.71 
 
 
512 aa  219  8e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
522 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
527 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.08 
 
 
525 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
505 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.32 
 
 
543 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  36.48 
 
 
528 aa  213  6e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 
468 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  34.69 
 
 
521 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 
489 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 
532 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
515 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.21 
 
 
519 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.84 
 
 
509 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
502 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 
452 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
520 aa  205  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.14 
 
 
529 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
487 aa  203  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 
458 aa  200  4e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 
527 aa  199  1e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 
488 aa  198  2e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  85.48 
 
 
558 aa  197  4e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  85.48 
 
 
243 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.29 
 
 
463 aa  196  8e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  2.85964e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.28 
 
 
763 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
498 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.89 
 
 
489 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  31.86 
 
 
500 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 
504 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.86 
 
 
476 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  37.47 
 
 
492 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  34.46 
 
 
513 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  191  3e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  191  3e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  191  3e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 
508 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  40.34 
 
 
444 aa  190  6e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
516 aa  190  6e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
486 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
478 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.29 
 
 
469 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
458 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
520 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
485 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
478 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
513 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
525 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.44 
 
 
511 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 
534 aa  185  1e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.4 
 
 
502 aa  186  1e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
478 aa  185  1e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
463 aa  185  2e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
521 aa  185  2e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
505 aa  185  2e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
484 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
478 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
483 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  36.66 
 
 
480 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 
480 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  34.02 
 
 
537 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
539 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 
478 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 
488 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.41 
 
 
489 aa  181  3e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.48 
 
 
503 aa  181  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
490 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 
499 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.68 
 
 
469 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>