More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3408 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  93.72 
 
 		 462 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  80.62 
 
 		 459 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  80.62 
 
 		 459 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  88.74 
 
 		 462 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  81.28 
 
 		 459 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  88.53 
 
 		 462 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  99.78 
 
 		 462 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  88.53 
 
 		 509 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  94.37 
 
 		 462 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  94.81 
 
 		 462 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  80.84 
 
 		 459 aa  716    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  89.61 
 
 		 462 aa  815    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  88.53 
 
 		 462 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  93.72 
 
 		 462 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  88.53 
 
 		 462 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  88.53 
 
 		 462 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 462 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  81.9 
 
 		 461 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  93.72 
 
 		 462 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  81.68 
 
 		 461 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  88.53 
 
 		 462 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  55.83 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  53.48 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  53.49 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  53.09 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  53.83 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  53.8 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  54.3 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  53.28 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  54.75 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  54.97 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  55.21 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  54.75 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  54.22 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  54.22 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  53.41 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  49.44 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  50.34 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  47.96 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  48.42 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  47.66 
 
 		 468 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  46.98 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  47.77 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  45.54 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  45.86 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  45.19 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  45.98 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  43.95 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  43.95 
 
 		 466 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  43.72 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  43.72 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  43.35 
 
 		 434 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  44.71 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  38.99 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  39.32 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  38.41 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  38.41 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  38.72 
 
 		 449 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  36.26 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.25 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  35.11 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  37.78 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  34.68 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  34.37 
 
 		 479 aa  226  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  32.83 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  35.02 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  30.65 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  34.34 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  33.63 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  35.19 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  34.49 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  32.72 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  35.8 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  35.57 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34046  Uric acid-xanthine permease (UAPA transporter)  32.02 
 
 		 590 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  32.79 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  32.95 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  32.95 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  33.71 
 
 		 505 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  32.72 
 
 		 440 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  35.33 
 
 		 451 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  35.25 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  32.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  32.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>