More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3356 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.75 
 
 		 423 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  96.73 
 
 		 396 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.41 
 
 		 396 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.9 
 
 		 396 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  96.22 
 
 		 396 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.25 
 
 		 405 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.25 
 
 		 423 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  94.96 
 
 		 396 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.75 
 
 		 405 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.9 
 
 		 396 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.92 
 
 		 396 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.75 
 
 		 423 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.97 
 
 		 396 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  88.35 
 
 		 394 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 		 410 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.25 
 
 		 423 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  96.22 
 
 		 396 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  98.54 
 
 		 410 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  76.34 
 
 		 401 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.54 
 
 		 402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66 
 
 		 402 aa  544  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  67.6 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.5 
 
 		 393 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.25 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.53 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.38 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.53 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.52 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.38 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.78 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.78 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.13 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.82 
 
 		 403 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.64 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.21 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.84 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.64 
 
 		 407 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.53 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.33 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.04 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.43 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.64 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.14 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.33 
 
 		 403 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.66 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.66 
 
 		 404 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.33 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  57.75 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.96 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.07 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.42 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.84 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.42 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.33 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.34 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.85 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.85 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.57 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.24 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.75 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.49 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.63 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  52.19 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.41 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  52.37 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.39 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.85 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.23 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.9 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.49 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.62 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.65 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.8 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.21 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.65 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.87 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.39 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.51 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  49.35 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.99 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.64 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.42 
 
 		 408 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.13 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.07 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.3 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  48.84 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.29 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.59 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.74 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.03 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.7 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.55 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.59 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.69 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.3 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.36 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.49 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>