More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3268 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  100 
 
 
495 aa  1018    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  48.67 
 
 
482 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.72 
 
 
473 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  30.58 
 
 
489 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.63 
 
 
526 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  27.8 
 
 
507 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.26 
 
 
517 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  28.54 
 
 
508 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.58 
 
 
474 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.31 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  27.42 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.38 
 
 
505 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.92 
 
 
511 aa  133  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  25.62 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.86 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.56 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  27.43 
 
 
536 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  27.24 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  26.11 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.7 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.25 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  29.44 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4359  arylsulfatase A-like enzyme  41.77 
 
 
142 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.884038  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  27.73 
 
 
509 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  27.29 
 
 
518 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  26.48 
 
 
481 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  25.34 
 
 
498 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.69 
 
 
481 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  25.74 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  26.73 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  27.84 
 
 
486 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.1 
 
 
503 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.63 
 
 
502 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  26.85 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  24.81 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.13 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.13 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.13 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  26.24 
 
 
501 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.55 
 
 
510 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  26.43 
 
 
503 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.74 
 
 
516 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  27.07 
 
 
518 aa  118  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.37 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  28.07 
 
 
614 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  27.69 
 
 
586 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  26.24 
 
 
478 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.38 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  28.79 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.02 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  25.9 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  25.86 
 
 
523 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.67 
 
 
511 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  25.77 
 
 
499 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  27.05 
 
 
496 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  23.66 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  26.53 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  25.92 
 
 
502 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  26.26 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.2 
 
 
501 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.94 
 
 
508 aa  110  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  26.83 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  26.29 
 
 
512 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.09 
 
 
459 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25.67 
 
 
498 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.29 
 
 
458 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  25.75 
 
 
572 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  25.94 
 
 
497 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  25.67 
 
 
505 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  26.43 
 
 
520 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  26.9 
 
 
496 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  26.36 
 
 
517 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  25.86 
 
 
505 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  26.84 
 
 
515 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.57 
 
 
493 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  26.7 
 
 
559 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.52 
 
 
501 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  24.79 
 
 
594 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  24.95 
 
 
485 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  28.32 
 
 
478 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  23.71 
 
 
522 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  25.86 
 
 
505 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.78 
 
 
564 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.1 
 
 
480 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.96 
 
 
502 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  25.6 
 
 
517 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  25.6 
 
 
517 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  25.6 
 
 
522 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  25.6 
 
 
522 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  25.6 
 
 
522 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  25.6 
 
 
522 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  25.6 
 
 
522 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.43 
 
 
514 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  24.66 
 
 
549 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  26.68 
 
 
476 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.7 
 
 
537 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  25.46 
 
 
512 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  25.96 
 
 
478 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  25.27 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  24.72 
 
 
565 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>