More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3246 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
289 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  99.31 
 
 
289 aa  582  1e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  91.7 
 
 
289 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  92.73 
 
 
289 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  92.73 
 
 
289 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  92.73 
 
 
289 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  92.73 
 
 
289 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  76.82 
 
 
289 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  76.12 
 
 
289 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  74.83 
 
 
290 aa  453  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  76.12 
 
 
289 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  75.43 
 
 
289 aa  447  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  2.56266e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  60.34 
 
 
295 aa  352  3e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  60 
 
 
295 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  59.66 
 
 
296 aa  338  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.06 
 
 
299 aa  337  2e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.5 
 
 
287 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  58.51 
 
 
285 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  56.18 
 
 
284 aa  298  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.63 
 
 
292 aa  289  5e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  53.9 
 
 
279 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  55.28 
 
 
312 aa  283  3e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.97 
 
 
276 aa  277  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.33 
 
 
330 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 
304 aa  270  3e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.66 
 
 
299 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 
285 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  48.39 
 
 
276 aa  266  3e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.68 
 
 
310 aa  265  6e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.83 
 
 
299 aa  265  6e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.5 
 
 
282 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  46.36 
 
 
302 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  50.18 
 
 
285 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.64 
 
 
300 aa  254  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  49.82 
 
 
284 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45 
 
 
300 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.21 
 
 
284 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.67 
 
 
289 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  48.06 
 
 
285 aa  245  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  50.35 
 
 
283 aa  244  2e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
284 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.5 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
278 aa  239  3e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  47.5 
 
 
284 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.14 
 
 
284 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
284 aa  234  1e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
284 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 
300 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.07 
 
 
284 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
284 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  46.07 
 
 
285 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  45.91 
 
 
284 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  43.93 
 
 
278 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  47.93 
 
 
276 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  46.83 
 
 
281 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.63 
 
 
280 aa  220  2e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.08 
 
 
290 aa  219  4e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  47.18 
 
 
282 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  45.99 
 
 
287 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 
288 aa  218  9e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  42.15 
 
 
277 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  42.15 
 
 
277 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  42.15 
 
 
277 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  42.15 
 
 
277 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  42.15 
 
 
277 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  45.02 
 
 
272 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  42.15 
 
 
277 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  48.57 
 
 
291 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  46.24 
 
 
289 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  42.15 
 
 
277 aa  215  6e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.61696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  42.15 
 
 
277 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  41.76 
 
 
277 aa  212  5e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  40.93 
 
 
276 aa  212  6e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  45.42 
 
 
280 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  47.35 
 
 
275 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  41.82 
 
 
274 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  41.82 
 
 
274 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.83 
 
 
627 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  45.58 
 
 
281 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  46.38 
 
 
310 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  41.7 
 
 
276 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  41.64 
 
 
278 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 
272 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  40.61 
 
 
277 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  47.94 
 
 
335 aa  201  1e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 
291 aa  201  1e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  45.91 
 
 
270 aa  200  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  43.63 
 
 
282 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.05 
 
 
292 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.96 
 
 
281 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  45.79 
 
 
687 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  43.07 
 
 
375 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.13 
 
 
276 aa  189  6e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  46.18 
 
 
282 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>