119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3224 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  83.15 
 
 		 545 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  82.39 
 
 		 540 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 543 aa  1075    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  82.39 
 
 		 540 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  73.25 
 
 		 588 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  82.39 
 
 		 540 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  95.41 
 
 		 545 aa  979    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  55.25 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  60.15 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  60.15 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  60.15 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  60.15 
 
 		 688 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  57.63 
 
 		 649 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  58.72 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  59.21 
 
 		 643 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.81 
 
 		 508 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  33.6 
 
 		 487 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  35 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.86 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  30.08 
 
 		 499 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.91 
 
 		 543 aa  94  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  29.73 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  35.71 
 
 		 596 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.85 
 
 		 511 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  31.25 
 
 		 504 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.2 
 
 		 513 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.85 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.79 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  29.19 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  31.41 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.03 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.12 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  35.97 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  31.89 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.83 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.82 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  32.73 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  27.61 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.59 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.06 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.92 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  29.97 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  31.88 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30.93 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  32.51 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  32.93 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  29.15 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.95 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  30.2 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.97 
 
 		 920 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  29.39 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.1 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.86 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.48 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  32.89 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.9 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  29.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.9 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.8 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  27.47 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  29.08 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.39 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.27 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  31.13 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.82 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.45 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  35.27 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  31.1 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  26.72 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.54 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  37.44 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  33.88 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  30.22 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.46 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  26.32 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  34.62 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.84 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  28.78 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.07 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  35.77 
 
 		 331 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  37.17 
 
 		 512 aa  57  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.72 
 
 		 344 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  34.3 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  28.99 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.22 
 
 		 358 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1245  CHAD domain containing protein  33.04 
 
 		 227 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  27.85 
 
 		 308 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  32.03 
 
 		 522 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.98 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  30.41 
 
 		 304 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.88 
 
 		 534 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  28.27 
 
 		 511 aa  50.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.91 
 
 		 347 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>