More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3196 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  97.77 
 
 		 462 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  95.01 
 
 		 491 aa  891    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  90.04 
 
 		 462 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  95.44 
 
 		 521 aa  895    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  95.44 
 
 		 462 aa  897    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  95.44 
 
 		 462 aa  897    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 462 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  66.23 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  66.52 
 
 		 465 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  64.44 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  65.11 
 
 		 465 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  64 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  64.22 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  63.78 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  62.83 
 
 		 465 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  54.68 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  44.64 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  41.5 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 476 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 473 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  40.26 
 
 		 469 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.21 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  32.43 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.18 
 
 		 473 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 465 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  32.56 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.84 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.05 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.9 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.14 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.98 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  31.41 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.07 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.32 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  30.34 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.08 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.34 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>