192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2970 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  99.06 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  94.87 
 
 		 212 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  95.85 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.36 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  96.2 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  96.2 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  95.65 
 
 		 212 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  67.14 
 
 		 212 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  65.26 
 
 		 212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  63.38 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  51.64 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  58.92 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  48.65 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  49.55 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  46.73 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  48.65 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  44.5 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  44.08 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  44.08 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  44.66 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  44.17 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.87 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.1 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.14 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.75 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.2 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  41.94 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.5 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  39.36 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  38.33 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  37.21 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  34.95 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  32.26 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  32.6 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  32.04 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.18 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  32.26 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  30.52 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  30.65 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.8 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  27.27 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.12 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.64 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  29.63 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.57 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.95 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.54 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.7 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>