193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2895 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
370 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  99.19 
 
 
370 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  96.49 
 
 
370 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  93.48 
 
 
369 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  94.86 
 
 
370 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  95.41 
 
 
370 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  95.41 
 
 
370 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  95.14 
 
 
370 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  93.48 
 
 
369 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  93.21 
 
 
369 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  93.48 
 
 
369 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  93.21 
 
 
369 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  93.21 
 
 
369 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  93.75 
 
 
369 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  93.21 
 
 
369 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  86.68 
 
 
369 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  87.5 
 
 
369 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  88.32 
 
 
369 aa  567  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  62.23 
 
 
367 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  63.32 
 
 
363 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  63.04 
 
 
363 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  62.46 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  63.09 
 
 
367 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  52.03 
 
 
396 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  52.03 
 
 
399 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  53.02 
 
 
383 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  49.33 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  50.95 
 
 
404 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  49.6 
 
 
391 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  45.95 
 
 
376 aa  298  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  48.04 
 
 
373 aa  292  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  48.78 
 
 
407 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  45.79 
 
 
406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  51.08 
 
 
398 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  47.71 
 
 
506 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  42.07 
 
 
411 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  48.46 
 
 
327 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  44.44 
 
 
348 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  44.38 
 
 
359 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.88 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  39.81 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  39.74 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  37.92 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  38.01 
 
 
335 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  45.34 
 
 
359 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  44.72 
 
 
359 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  38.39 
 
 
326 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  43.45 
 
 
357 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  43.38 
 
 
345 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  45.77 
 
 
357 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  36.84 
 
 
339 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  43.15 
 
 
357 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  44.63 
 
 
359 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  40.98 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 
361 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  33.86 
 
 
387 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  38.04 
 
 
327 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  41.54 
 
 
327 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
325 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  34.42 
 
 
353 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  38.04 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.16 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  32.89 
 
 
387 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  44.12 
 
 
356 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  35.95 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 
327 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  42.12 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  36.89 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
325 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  36.28 
 
 
325 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  40.95 
 
 
356 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.39 
 
 
352 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 
352 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 
352 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.77 
 
 
394 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  34.19 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  35.02 
 
 
354 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  33.72 
 
 
671 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.9 
 
 
311 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  28.71 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  28.19 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  36.18 
 
 
313 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  36.18 
 
 
313 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
307 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  32.68 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  34.48 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  30.62 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  31.71 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.98 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.3 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  36.18 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.81 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.31 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.39 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>