296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2831 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  40.58 
 
 		 854 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  61.11 
 
 		 929 aa  1061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  40.58 
 
 		 854 aa  664    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 887 aa  1800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  46.36 
 
 		 872 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  45.34 
 
 		 875 aa  718    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.58 
 
 		 863 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  45.91 
 
 		 883 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  47.89 
 
 		 868 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.91 
 
 		 883 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.54 
 
 		 864 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.33 
 
 		 850 aa  592  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  38.75 
 
 		 853 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  38.75 
 
 		 853 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  38.64 
 
 		 853 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  38.37 
 
 		 853 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  38.64 
 
 		 853 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  37.61 
 
 		 913 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  37.44 
 
 		 914 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  37.44 
 
 		 914 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.31 
 
 		 901 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  36.19 
 
 		 901 aa  515  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  36.77 
 
 		 939 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.59 
 
 		 886 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.73 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.84 
 
 		 867 aa  499  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.93 
 
 		 861 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.62 
 
 		 856 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.76 
 
 		 866 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.05 
 
 		 866 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.31 
 
 		 880 aa  486  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.51 
 
 		 930 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.09 
 
 		 852 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.32 
 
 		 872 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.75 
 
 		 852 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.74 
 
 		 1040 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.84 
 
 		 880 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  36.68 
 
 		 842 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.49 
 
 		 851 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.44 
 
 		 884 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  34.45 
 
 		 844 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.76 
 
 		 870 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  33.87 
 
 		 870 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.62 
 
 		 963 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.38 
 
 		 871 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.66 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.86 
 
 		 819 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.27 
 
 		 877 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.41 
 
 		 851 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  31.24 
 
 		 870 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  31.46 
 
 		 870 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  31.24 
 
 		 870 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  31.35 
 
 		 870 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.26 
 
 		 833 aa  386  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.4 
 
 		 890 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  31.35 
 
 		 870 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  30.95 
 
 		 833 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.73 
 
 		 866 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.77 
 
 		 875 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  33.41 
 
 		 850 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  33.52 
 
 		 833 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.77 
 
 		 875 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  30.8 
 
 		 866 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  30.85 
 
 		 878 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.49 
 
 		 888 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  30.85 
 
 		 878 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.73 
 
 		 866 aa  373  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.85 
 
 		 878 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  30.73 
 
 		 866 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  30.8 
 
 		 866 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  30.85 
 
 		 878 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  30.87 
 
 		 865 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  33.3 
 
 		 833 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.64 
 
 		 840 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  30.27 
 
 		 888 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  32.96 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.13 
 
 		 828 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  31.52 
 
 		 829 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  30.38 
 
 		 873 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  30.61 
 
 		 866 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.27 
 
 		 888 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  31.88 
 
 		 829 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  30.52 
 
 		 863 aa  366  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  30.38 
 
 		 888 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.83 
 
 		 837 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.3 
 
 		 831 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.3 
 
 		 876 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.8 
 
 		 832 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.5 
 
 		 866 aa  364  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  30.74 
 
 		 856 aa  363  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  29.31 
 
 		 861 aa  360  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  29.31 
 
 		 866 aa  360  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.33 
 
 		 865 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  30.02 
 
 		 869 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  30.02 
 
 		 869 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  31.37 
 
 		 842 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  30.25 
 
 		 869 aa  357  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  31.37 
 
 		 842 aa  357  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.72 
 
 		 826 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.72 
 
 		 826 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>