56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2781 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  99.04 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  96.15 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  95.19 
 
 		 208 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  95.67 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  95.67 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  94.71 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  81.13 
 
 		 215 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  78.6 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  78.6 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  78.6 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  78.6 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  78.6 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  78.14 
 
 		 215 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  74.88 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  72.95 
 
 		 214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  72.95 
 
 		 214 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  41.01 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  42.37 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  42.37 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  40.74 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  35.53 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  34.25 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  32.29 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  35.64 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  31.32 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  37.07 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  32.87 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  38.89 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  34.4 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  31.85 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  29.95 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  30.1 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  32.8 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  27.84 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  30.83 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  27.43 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.72 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.72 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  25.64 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  24.08 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  25.26 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  26.29 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  22.34 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.93 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  23.76 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  20.5 
 
 		 205 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  30.63 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>