More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2721 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  98.25 
 
 		 254 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  98.25 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  98.68 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  98.25 
 
 		 254 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  97.38 
 
 		 236 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  85.59 
 
 		 253 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  85.59 
 
 		 253 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  85.59 
 
 		 253 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  85.59 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  85.59 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  85.59 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  85.59 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  75 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  86.46 
 
 		 253 aa  344  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  74.56 
 
 		 243 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  72.37 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  64.02 
 
 		 257 aa  284  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  62.32 
 
 		 240 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  69.23 
 
 		 238 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  63.59 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  62.33 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  71.5 
 
 		 203 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  69.23 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  69.23 
 
 		 236 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  69.23 
 
 		 236 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  61.57 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  58 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  61.62 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  57.79 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  56.25 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  58.29 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  57.79 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  54.81 
 
 		 281 aa  231  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  54.07 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  54.33 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  53.66 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  48.34 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  49.21 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  37.99 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.36 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  40.88 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  37.06 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  38.07 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.26 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  38.15 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  37.65 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  38.07 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  38.01 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  37.99 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  37.06 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  37.99 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.32 
 
 		 318 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  34.71 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.87 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.5 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  35.67 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  35.67 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  37.43 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  36.52 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34.83 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.64 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.78 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.06 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.06 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  35.39 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.27 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.97 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  35.2 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.71 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.5 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  35.29 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  35.29 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.69 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.64 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  35 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  39.41 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.92 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>