More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2708 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2708  porin  100 
 
 		 400 aa  792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  98 
 
 		 400 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  66.5 
 
 		 400 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  54.98 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  54.28 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  52.7 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  52.7 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  52.7 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  52.7 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  54.07 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  52.7 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  53.64 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  52.7 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  52.93 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  54.32 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  54.32 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  54.32 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  52.45 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  54.19 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  53.94 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  55.37 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  52.96 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  53.69 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  51.41 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  50.37 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  49.64 
 
 		 409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  51.96 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  50.91 
 
 		 403 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  54.07 
 
 		 352 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  47.92 
 
 		 409 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  46.51 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  47.9 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  44.2 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  46.31 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  44.94 
 
 		 393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  46.46 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  42.16 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.64 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  44.28 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  45.27 
 
 		 412 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  45.93 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  44.04 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  42.14 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  44.42 
 
 		 386 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  44.42 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  44.42 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  44.22 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  42.82 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  43.03 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  43.2 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  43.15 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  44.02 
 
 		 385 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  41.61 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  41.15 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  43.3 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  41.61 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  43.11 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  41.79 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  43.91 
 
 		 393 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.58 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.15 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  42.2 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  41.42 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.93 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  40.72 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  43.57 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  43.57 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  42.51 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  41.71 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  41.71 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  44.5 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  42.45 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  42.45 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  42.45 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  42.45 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  43.31 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.44 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.27 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  41.55 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.09 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  41.15 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  42.19 
 
 		 384 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  41.67 
 
 		 430 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  41.67 
 
 		 430 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.51 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.55 
 
 		 421 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.55 
 
 		 421 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  40.45 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.06 
 
 		 397 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  43.39 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>