More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2678 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  96.74 
 
 
307 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  96.74 
 
 
307 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  96.09 
 
 
307 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  96.09 
 
 
307 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  96.09 
 
 
307 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  93.16 
 
 
307 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  92.83 
 
 
307 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  92.83 
 
 
307 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  92.83 
 
 
307 aa  593  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  92.51 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  79.48 
 
 
306 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  76.47 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  70.92 
 
 
310 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  71.01 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  71.66 
 
 
306 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  71.7 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  71.34 
 
 
312 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  71.66 
 
 
312 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  70.36 
 
 
313 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  69.71 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  73.62 
 
 
307 aa  464  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
312 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  72.08 
 
 
307 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  70.03 
 
 
312 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  68.73 
 
 
312 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  71.99 
 
 
305 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  68.73 
 
 
313 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 
316 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  67.43 
 
 
306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  69.02 
 
 
296 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  67.75 
 
 
306 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 
307 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  67.43 
 
 
306 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  64.82 
 
 
307 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  64.82 
 
 
307 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 
306 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  64.17 
 
 
307 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  62.99 
 
 
309 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 
311 aa  421  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  64.38 
 
 
309 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  64.17 
 
 
307 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  64.38 
 
 
308 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
306 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  63.52 
 
 
306 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  64.71 
 
 
309 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  63.73 
 
 
309 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
307 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  63.52 
 
 
306 aa  408  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  61.56 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.66 
 
 
305 aa  391  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  59.21 
 
 
307 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  60.59 
 
 
309 aa  388  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  58.55 
 
 
307 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  58.28 
 
 
307 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  58.28 
 
 
307 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 
307 aa  374  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  59.41 
 
 
304 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  58.05 
 
 
317 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  58.5 
 
 
304 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  58.5 
 
 
304 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  58.17 
 
 
304 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  56.95 
 
 
306 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 
304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  55.84 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  57 
 
 
304 aa  350  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  56.33 
 
 
304 aa  348  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  57.86 
 
 
304 aa  347  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  56 
 
 
304 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  56.86 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  54.52 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  54.61 
 
 
304 aa  338  7e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
309 aa  318  9e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  53.14 
 
 
339 aa  311  5.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  51.82 
 
 
319 aa  310  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  53.33 
 
 
312 aa  308  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  50.68 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  48.86 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
312 aa  300  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
319 aa  299  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
307 aa  295  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 
308 aa  293  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  49.33 
 
 
319 aa  292  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
304 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.31 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>