166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2677 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  98.41 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  94.82 
 
 		 272 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  94.82 
 
 		 272 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  94.82 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  92.83 
 
 		 251 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  96.81 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  84.34 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  83.4 
 
 		 253 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  84.34 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  83.53 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  83.53 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  83.53 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  83.94 
 
 		 249 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  83.53 
 
 		 249 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  76.1 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  77.46 
 
 		 248 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  76.21 
 
 		 248 aa  347  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  58.13 
 
 		 266 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  57.55 
 
 		 276 aa  284  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  56.28 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  56.22 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  55.47 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  46.35 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  51.69 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  51.21 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  50.76 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  48.76 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  46.89 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  43.93 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  45.78 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  45.51 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  43.78 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  42.79 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  35.29 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  34.96 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  35.43 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  33.19 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.57 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.8 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.56 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  33.18 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  34.65 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  33.62 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  31.84 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  33.18 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.49 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  33.33 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  29.96 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  30.7 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.96 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  29.46 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  34.06 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.77 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  34.06 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  30.8 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  34.5 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.57 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  33.88 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.36 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  33.88 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.61 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  26.27 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.83 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.88 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  29.17 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  32.08 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.9 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.75 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.75 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.75 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.75 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.76 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  29.18 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  27.68 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  26.61 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  26.61 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.52 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.76 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  28.57 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  31.65 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.06 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.4 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  26.61 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  25.73 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  27.12 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  26.43 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  26.58 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  28.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  26.58 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  26.78 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  23.58 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  27.42 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  27.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  27.18 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  25.46 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  25.95 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  24.89 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  23.89 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>