More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2590 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  97.16 
 
 		 388 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  100 
 
 		 425 aa  809    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  90.32 
 
 		 403 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  84.86 
 
 		 403 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  90.02 
 
 		 403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  89.53 
 
 		 403 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  72.94 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  72.94 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  72.94 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  72.42 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  72.16 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  71.39 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  65.99 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  61.65 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  90.24 
 
 		 330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  64.87 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  60.71 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  63.73 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  63.33 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  54.52 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  51.7 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.61 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  55.47 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  57.97 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  64.19 
 
 		 401 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  58.03 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  54.32 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  54.32 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  46.97 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  48.2 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  53.92 
 
 		 405 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.58 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.58 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  51.91 
 
 		 412 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.18 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  53.71 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  49.23 
 
 		 393 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  47.94 
 
 		 393 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.64 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  54.04 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  57.54 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  49.34 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  51.6 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  48.2 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  47.16 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  47.94 
 
 		 393 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.61 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  47.68 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  55.81 
 
 		 417 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  47.68 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.64 
 
 		 391 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  53.44 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  51.26 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  47.94 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.3 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  58.03 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.32 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  53 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  51.17 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  63.1 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  52.74 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.58 
 
 		 411 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.58 
 
 		 411 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  56.48 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  57.59 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  48.88 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  51.83 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  42.53 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  41.02 
 
 		 383 aa  263  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  44.39 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  42.86 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  42.56 
 
 		 383 aa  259  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  45.41 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  44.41 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  44.18 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  44.21 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  40.38 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  43.62 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  40.67 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  42.71 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  40.62 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  43.44 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  41.22 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  40.97 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  44.23 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.03 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  39.69 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  40.87 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  42.64 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  44.42 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  41.87 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  46.1 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  32.44 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  59.87 
 
 		 158 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.03 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.76 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03341  chromate ion transporter (Eurofung)  31 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156083  normal  0.912193 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  32.08 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>