More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2580 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  526  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  526  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  97.98 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  97.58 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  97.58 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  97.58 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  97.18 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 248 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  86.69 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 248 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  86.29 
 
 		 248 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 244 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  70.66 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 244 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  67.92 
 
 		 244 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  66.25 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  65.83 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  65.83 
 
 		 244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 244 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  65 
 
 		 244 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  65 
 
 		 244 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  63.79 
 
 		 244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 244 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 247 aa  314  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  63.86 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  53.85 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  47.64 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  45.73 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40.43 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  42.79 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  41.92 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.46 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.18 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>