More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2470 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  97.6 
 
 		 250 aa  487  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  95.18 
 
 		 250 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  95.18 
 
 		 250 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  95.18 
 
 		 250 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  93.98 
 
 		 250 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  92.77 
 
 		 250 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  71.2 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  72.29 
 
 		 250 aa  362  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  71.6 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  71.31 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  71.31 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  71.31 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  70.52 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  70.52 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  70.52 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  70.52 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  70.12 
 
 		 251 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  56.35 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  57.92 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  51.82 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  52.02 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.61 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  50.4 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  54.76 
 
 		 254 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.76 
 
 		 254 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.21 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.21 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.03 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  50.81 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  50.81 
 
 		 256 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.81 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.44 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  52.03 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  52.24 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  51.82 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  52.67 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  50.61 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  48.79 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  52.42 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  51.2 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  53.82 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  51 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  45.75 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  48.21 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  48.5 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  49.4 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.26 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  48.26 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  50.54 
 
 		 212 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.76 
 
 		 207 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  51.1 
 
 		 187 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  50 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  36.6 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.06 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.06 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  28.45 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.03 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  27.62 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.03 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.57 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 415 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.7 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.06 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  42.42 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.54 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.91 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.22 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.41 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.25 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.58 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.53 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.47 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>