More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2414 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2414  phage integrase family protein  100 
 
 		 358 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  27.12 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  27.72 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.32 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  26.74 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.32 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.98 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.09 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  29.05 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.29 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.35 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  29.63 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  26.91 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.92 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  29.8 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  27.9 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  26.4 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  30.9 
 
 		 395 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  28.5 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  28.85 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.86 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.1 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.67 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  31.76 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  31.76 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  31.76 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  25.47 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  25.93 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  27.68 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.75 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.91 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.4 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  27.36 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.73 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  25.88 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  33.12 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  26.47 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  27.48 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  30.61 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.72 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  21.64 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  25.55 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.3 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  20.7 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.41 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.58 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  23.48 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.3 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.58 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.58 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.3 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  26.24 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.6 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  23.58 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  25.82 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.93 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.27 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  21.31 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  21.31 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  21.31 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.57 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.23 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  23.08 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  25.55 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  23.98 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.55 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.96 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>