220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2362 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  56.06 
 
 		 619 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  56.81 
 
 		 620 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  57.52 
 
 		 608 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  60.32 
 
 		 619 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  55.16 
 
 		 605 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  54.64 
 
 		 605 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  57.24 
 
 		 602 aa  658    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  57.5 
 
 		 598 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  60.03 
 
 		 616 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  59.22 
 
 		 617 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  53.68 
 
 		 629 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  55.34 
 
 		 614 aa  670    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  96.07 
 
 		 609 aa  1205    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  54.13 
 
 		 627 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  57.94 
 
 		 613 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  84.21 
 
 		 665 aa  1067    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  57.07 
 
 		 600 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  58.02 
 
 		 598 aa  661    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  57.31 
 
 		 628 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  55.81 
 
 		 601 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  58.33 
 
 		 611 aa  695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  57.85 
 
 		 600 aa  703    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  59.49 
 
 		 623 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  58.21 
 
 		 596 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  76.54 
 
 		 626 aa  978    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  56.34 
 
 		 601 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  60.1 
 
 		 593 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  54.34 
 
 		 597 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  76.84 
 
 		 727 aa  877    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  95.74 
 
 		 609 aa  1199    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  56.02 
 
 		 601 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 611 aa  1248    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  59.83 
 
 		 597 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  56.23 
 
 		 619 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  95.91 
 
 		 609 aa  1202    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  55.65 
 
 		 627 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  57.8 
 
 		 602 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  57.85 
 
 		 586 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  59.49 
 
 		 623 aa  752    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  96.46 
 
 		 609 aa  1182    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  55.69 
 
 		 602 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  57.41 
 
 		 602 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  76.87 
 
 		 626 aa  985    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  56.5 
 
 		 602 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  98.36 
 
 		 609 aa  1229    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  55.42 
 
 		 596 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  84.9 
 
 		 610 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  56.37 
 
 		 601 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  55.89 
 
 		 610 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  55.65 
 
 		 629 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  57.31 
 
 		 629 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  56.8 
 
 		 594 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  56.69 
 
 		 603 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  95.91 
 
 		 609 aa  1202    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  57 
 
 		 600 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  54.9 
 
 		 605 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  53.56 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  52.75 
 
 		 626 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  54.33 
 
 		 602 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  52.02 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  52.75 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  49.83 
 
 		 589 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  51.53 
 
 		 596 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 		 850 aa  571  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  47.76 
 
 		 605 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  48.12 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  47.6 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  49.08 
 
 		 629 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  48.9 
 
 		 593 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  47.43 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  47.54 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  46.93 
 
 		 604 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  43.72 
 
 		 632 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  43.89 
 
 		 636 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  43.22 
 
 		 639 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  42.64 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  40.98 
 
 		 627 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  39.57 
 
 		 612 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  41.79 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  37.79 
 
 		 612 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  40.62 
 
 		 625 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  40.66 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  40.23 
 
 		 612 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  41.02 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  40.4 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  40 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  41.15 
 
 		 599 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  39.84 
 
 		 599 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  40.47 
 
 		 608 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  39.32 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  39.06 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.15 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  39.77 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>