209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2334 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  99.35 
 
 
306 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  96.09 
 
 
323 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  96.09 
 
 
323 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  95.11 
 
 
307 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  95.44 
 
 
307 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  94.14 
 
 
307 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  86.32 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  86.32 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  86.32 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  86.64 
 
 
307 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  86.64 
 
 
307 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  86.32 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  86.64 
 
 
326 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  85.67 
 
 
326 aa  539  1e-152  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  81.76 
 
 
307 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  81.61 
 
 
310 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  80.78 
 
 
307 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  72.76 
 
 
302 aa  451  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1990  coproporphyrinogen III oxidase  72.43 
 
 
302 aa  452  1e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0815567  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  73.09 
 
 
302 aa  451  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  72.76 
 
 
303 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2524  coproporphyrinogen III oxidase  72.09 
 
 
303 aa  446  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1730  coproporphyrinogen III oxidase  69.93 
 
 
307 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  68.03 
 
 
302 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1970  coproporphyrinogen III oxidase  68.08 
 
 
308 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  69.1 
 
 
306 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  68.4 
 
 
303 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  65.78 
 
 
298 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1951  coproporphyrinogen III oxidase  68.27 
 
 
315 aa  414  1e-115  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  69.7 
 
 
305 aa  416  1e-115  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  66.78 
 
 
299 aa  411  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2077  coproporphyrinogen III oxidase  67.68 
 
 
310 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.727472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
334 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  67.76 
 
 
323 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  68.11 
 
 
323 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1705  coproporphyrinogen III oxidase  64.11 
 
 
339 aa  405  1e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0573078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 
310 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3523  coproporphyrinogen III oxidase  60.46 
 
 
354 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42792  normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  63.37 
 
 
310 aa  399  1e-110  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  65.26 
 
 
304 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 
323 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  62.33 
 
 
299 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  62.33 
 
 
299 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  61.51 
 
 
305 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  62.33 
 
 
299 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  62.58 
 
 
303 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  61.33 
 
 
299 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  63.31 
 
 
309 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  62.3 
 
 
323 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  61.67 
 
 
299 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  61.67 
 
 
299 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  62.62 
 
 
302 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  62.25 
 
 
317 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  61.97 
 
 
302 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  5.53459e-06 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  64.92 
 
 
313 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  62.3 
 
 
302 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 
302 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  61.33 
 
 
299 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 
299 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  62.3 
 
 
302 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  63.96 
 
 
304 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  61.97 
 
 
302 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49114e-08 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  61 
 
 
299 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 
302 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  59.81 
 
 
310 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  61.59 
 
 
302 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  62.25 
 
 
304 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  62.79 
 
 
309 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1441  coproporphyrinogen III oxidase  63.79 
 
 
302 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  61.87 
 
 
310 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0616  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 
310 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 
299 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  63.21 
 
 
307 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  61.36 
 
 
305 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  59.34 
 
 
306 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  60.84 
 
 
333 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  61.36 
 
 
305 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  60.6 
 
 
304 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  60.98 
 
 
304 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 
306 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  58.14 
 
 
309 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  59.4 
 
 
303 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  58.88 
 
 
305 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  60.33 
 
 
312 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  58.14 
 
 
311 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  58.61 
 
 
305 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  58.28 
 
 
307 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  62.75 
 
 
299 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  62.42 
 
 
298 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  58.55 
 
 
305 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  59.02 
 
 
306 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  59.6 
 
 
309 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  60.4 
 
 
304 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  60.53 
 
 
304 aa  363  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>