137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2308 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  93.62 
 
 
355 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  100 
 
 
330 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  99.04 
 
 
312 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  93.91 
 
 
312 aa  620  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  93.91 
 
 
312 aa  620  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  93.91 
 
 
312 aa  620  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  90.71 
 
 
312 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  85.9 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  87.1 
 
 
312 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  81.59 
 
 
313 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  80 
 
 
315 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  81.27 
 
 
313 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  75.65 
 
 
332 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  78.99 
 
 
314 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  71.99 
 
 
309 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  78.08 
 
 
316 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  72.47 
 
 
316 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  67.92 
 
 
309 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  70.28 
 
 
268 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  59.47 
 
 
286 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  58.57 
 
 
315 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  59.56 
 
 
289 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  60.96 
 
 
276 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  64.17 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  64.17 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  62.6 
 
 
325 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  58.58 
 
 
310 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  60.16 
 
 
270 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  58.3 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  59.11 
 
 
272 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  55.22 
 
 
270 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  55.43 
 
 
270 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  55.22 
 
 
270 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  56.69 
 
 
301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  58.16 
 
 
280 aa  309  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  59 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  55.56 
 
 
269 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  54.02 
 
 
270 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  53.05 
 
 
265 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  53.79 
 
 
265 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  55.56 
 
 
303 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  53.41 
 
 
270 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  53.41 
 
 
265 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  55.42 
 
 
290 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  55.23 
 
 
268 aa  292  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  52.47 
 
 
266 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  52.27 
 
 
265 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  52.85 
 
 
275 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  54.66 
 
 
283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  51.13 
 
 
278 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  54.37 
 
 
275 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  51 
 
 
288 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  51.04 
 
 
279 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  53.39 
 
 
273 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.54 
 
 
273 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  52.34 
 
 
280 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  52.12 
 
 
273 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  52.54 
 
 
270 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  52.97 
 
 
270 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  51.56 
 
 
280 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  54.24 
 
 
265 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  52.87 
 
 
255 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  53.81 
 
 
265 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  53.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  52.02 
 
 
270 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  50.4 
 
 
274 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  51.34 
 
 
273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  51.7 
 
 
273 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.7 
 
 
273 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  48.83 
 
 
271 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  47.21 
 
 
277 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  50.41 
 
 
286 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  46.67 
 
 
272 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  48.08 
 
 
267 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  46.59 
 
 
265 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  50.21 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  48.75 
 
 
275 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  47.08 
 
 
298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  41.99 
 
 
300 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  42.06 
 
 
267 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
286 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  40.07 
 
 
355 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  42.91 
 
 
360 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  42.91 
 
 
357 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  42.91 
 
 
360 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  42.51 
 
 
352 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3659  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
288 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5686  metallophosphoesterase  44.4 
 
 
275 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  38.68 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  42.23 
 
 
283 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0632  metallophosphoesterase  46.47 
 
 
266 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0975218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>