109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2227 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  90.36 
 
 		 83 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  84.15 
 
 		 83 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  79.27 
 
 		 83 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  77.11 
 
 		 83 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  73.49 
 
 		 83 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  67.86 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  51.85 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  51.85 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6532  PAAR repeat-containing protein  72.92 
 
 		 52 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  49.41 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  48.78 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  45.68 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  45.57 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  47.62 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  48.75 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  44.71 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  44.71 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  48.19 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  46.99 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  48.19 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  46.34 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  45.57 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  45.45 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  48.1 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  44.87 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  41.03 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  44.3 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  43.59 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  41.98 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  40.51 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  39.74 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  48.48 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  46.15 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  44.87 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  44.87 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  44.87 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  44.87 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  44.87 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  41.03 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  36.25 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.68 
 
 		 1527 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  41.46 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  43.59 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  36.14 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  39.74 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  38.67 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  39.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1541 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1381 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1553 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  38.46 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  38.46 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  34.18 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  39.51 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  37.97 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  39.51 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  36.67 
 
 		 1517 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  36.49 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  35.14 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  38.27 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  37.18 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  41.56 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>