241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1995 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  63.72 
 
 		 230 aa  284  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.64 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  55.65 
 
 		 228 aa  254  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.66 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.86 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  55.86 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  52.65 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.55 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  48.44 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  49.55 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.88 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  45.37 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  43.1 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.12 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.25 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  42.04 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  41.41 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  39.57 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  39.65 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  39.65 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  39.65 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.05 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  39.13 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  39.21 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  39.57 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  43.04 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  42.55 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  40.68 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  40.79 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  41.38 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  41.7 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.7 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  38.24 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  39.66 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  40.79 
 
 		 378 aa  164  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  41.95 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.79 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  40.43 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  42.61 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.49 
 
 		 249 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  40.61 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  41.63 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.05 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  40.95 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  40.36 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  39.01 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.6 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  39.46 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  39.91 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.24 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  41.74 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  38.67 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  38.16 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  39.01 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  39.01 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  39.01 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.37 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.13 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  36.52 
 
 		 267 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  41.56 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  37.89 
 
 		 357 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  39.74 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.24 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  40.87 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.21 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.33 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  35.29 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  40.26 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  36.52 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  37.39 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  41.31 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  41.31 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.12 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  36.32 
 
 		 366 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  38.46 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.86 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  37.55 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  37.39 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  35.34 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.43 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  33.04 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  37.89 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.87 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>