More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1971 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  88.14 
 
 		 388 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  77.84 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  77.85 
 
 		 325 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  63.06 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  45.82 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  42.55 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  40.66 
 
 		 360 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  43.42 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  53.66 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.25 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  28.42 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.51 
 
 		 355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  37.08 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  35.35 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  37.13 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  37.65 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  39.6 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  40.48 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 328 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  34.22 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  38.78 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  38.78 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  32.59 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  31.94 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.98 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  38 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  32.3 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  38.55 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  38.81 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  35.84 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  38.55 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  35.02 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.33 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  34.57 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  35.29 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  44.52 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  34.51 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.55 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 		 332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 		 332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  38.86 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  37.93 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  38.15 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  39.88 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  37.14 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  37.93 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  31.85 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  39.35 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  36.76 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 336 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  32.67 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  41.36 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  37.87 
 
 		 459 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  42.04 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  37.27 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  34.97 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.83 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  40.62 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  40.41 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  35.88 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.61 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  34.08 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  35.33 
 
 		 243 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  41.32 
 
 		 639 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  42.95 
 
 		 613 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.57 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  39.52 
 
 		 601 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  35.71 
 
 		 640 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  35.71 
 
 		 640 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.63 
 
 		 759 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 		 637 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  37.59 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  36.9 
 
 		 641 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.07 
 
 		 662 aa  96.3  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 		 639 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  34.52 
 
 		 642 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  31.4 
 
 		 633 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.16 
 
 		 760 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30 
 
 		 743 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.37 
 
 		 718 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  30.81 
 
 		 633 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.81 
 
 		 632 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  32.3 
 
 		 693 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>