More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1927 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  91.48 
 
 
445 aa  822  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.55 
 
 
449 aa  780  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  97.35 
 
 
453 aa  887  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  91.7 
 
 
445 aa  823  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  91.83 
 
 
452 aa  836  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  91.83 
 
 
452 aa  836  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  96.91 
 
 
453 aa  884  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
453 aa  902  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  91.7 
 
 
445 aa  823  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  97.35 
 
 
453 aa  887  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.48 
 
 
453 aa  867  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  91.48 
 
 
445 aa  821  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.77 
 
 
449 aa  782  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  91.7 
 
 
445 aa  821  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  900  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  4.87933e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  96.69 
 
 
453 aa  880  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  91.48 
 
 
445 aa  822  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  7.98172e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87 
 
 
449 aa  790  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.01 
 
 
453 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  54.98 
 
 
453 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.75 
 
 
453 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  53.69 
 
 
449 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.38 
 
 
449 aa  454  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  42 
 
 
471 aa  336  6e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
509 aa  328  1e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.92 
 
 
434 aa  327  4e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  41.09 
 
 
500 aa  320  2e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
501 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  41.57 
 
 
501 aa  315  1e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  43.53 
 
 
471 aa  313  4e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
458 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
459 aa  310  3e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  41.45 
 
 
442 aa  305  1e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
505 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
474 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  40.87 
 
 
433 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  41.4 
 
 
471 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.3 
 
 
435 aa  202  1e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  35.28 
 
 
430 aa  201  2e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.75 
 
 
430 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  33.41 
 
 
438 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  32.15 
 
 
438 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  40.65 
 
 
438 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  41.16 
 
 
436 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  37.43 
 
 
440 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  40.65 
 
 
438 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  40.29 
 
 
438 aa  186  1e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  31.79 
 
 
436 aa  185  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  40.79 
 
 
436 aa  186  1e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  40.07 
 
 
438 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  39.57 
 
 
438 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 
450 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.44 
 
 
444 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  40.29 
 
 
438 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  40.29 
 
 
429 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  32.43 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
450 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  32.13 
 
 
450 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  39.93 
 
 
438 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
447 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
447 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
447 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
447 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  32.43 
 
 
447 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  39.35 
 
 
438 aa  174  3e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  31.52 
 
 
430 aa  174  3e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.2 
 
 
450 aa  173  6e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  38.85 
 
 
446 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  30.3 
 
 
432 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  31.07 
 
 
448 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  35.48 
 
 
437 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.05 
 
 
470 aa  166  6e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
438 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
438 aa  164  4e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
429 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  34.31 
 
 
440 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  32.62 
 
 
459 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 
453 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
428 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  31.36 
 
 
453 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  31.47 
 
 
452 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  34.02 
 
 
440 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  38.71 
 
 
439 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
438 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
438 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
451 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  38.35 
 
 
439 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
427 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  31.99 
 
 
438 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
437 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
437 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
438 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
437 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
437 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>