More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1788 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  100 
 
 
158 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  96.84 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  98.1 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  96.2 
 
 
158 aa  313  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  96.2 
 
 
158 aa  313  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  94.94 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  91.14 
 
 
158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  81.53 
 
 
162 aa  275  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  81.53 
 
 
162 aa  275  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  81.53 
 
 
162 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  81.53 
 
 
162 aa  275  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  82.17 
 
 
162 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  82.17 
 
 
162 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  81.53 
 
 
162 aa  275  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  78.95 
 
 
158 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  77.63 
 
 
158 aa  254  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  74.19 
 
 
158 aa  253  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2202  molybdopterin converting factor, subunit 2  82.28 
 
 
166 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00335655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  71.05 
 
 
163 aa  229  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  67.32 
 
 
166 aa  224  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  64.71 
 
 
173 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  67.55 
 
 
158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  64.71 
 
 
173 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  66.89 
 
 
158 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  65.16 
 
 
176 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  65.16 
 
 
172 aa  214  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  64.94 
 
 
158 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  64.63 
 
 
150 aa  204  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  59.74 
 
 
163 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  59.73 
 
 
154 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  58.5 
 
 
149 aa  201  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  60.53 
 
 
157 aa  201  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  60.54 
 
 
175 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.84 
 
 
159 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  64.38 
 
 
151 aa  196  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.63 
 
 
169 aa  196  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.49 
 
 
153 aa  196  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  60.78 
 
 
165 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  59.86 
 
 
155 aa  188  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2196  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.19 
 
 
188 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00121089  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0588  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  59.86 
 
 
163 aa  184  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  59.59 
 
 
150 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.34 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  57.82 
 
 
150 aa  176  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2145  molybdopterin synthase subunit MoaE  55.41 
 
 
153 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  57.82 
 
 
148 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  56.46 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  57.53 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0966  molybdopterin biosynthesis MoaE  58.9 
 
 
150 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  56.16 
 
 
146 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.35 
 
 
148 aa  164  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0477  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.74 
 
 
148 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  51.37 
 
 
150 aa  163  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  57.05 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1880  molybdopterin-converting factor subunit 2  52.05 
 
 
148 aa  158  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  157  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0955  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  54.68 
 
 
150 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.38 
 
 
155 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002958  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  49.32 
 
 
151 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  51.7 
 
 
155 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1028  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
150 aa  156  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11280  Molybdopterin converting factor, large subunit  56.85 
 
 
148 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.34 
 
 
154 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0808  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.05 
 
 
150 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00409432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0841  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.96 
 
 
150 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0932  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.96 
 
 
150 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0900  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.96 
 
 
150 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.68 
 
 
152 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0869  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  53.96 
 
 
150 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3528  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  51.37 
 
 
152 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0848  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.37 
 
 
150 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  51.37 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2857  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.37 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2858  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.37 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  hitchhiker  0.00457417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0933  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  50.68 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00769  hypothetical protein  51.37 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  52.38 
 
 
147 aa  154  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0839  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.37 
 
 
150 aa  153  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2522  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  52.05 
 
 
150 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4555  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.79 
 
 
148 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2567  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.37 
 
 
150 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.149869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1495  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.32 
 
 
372 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1294  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.79 
 
 
148 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4116  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
148 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2155  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
154 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  47.71 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1174  molybdopterin biosynthesis MoaE  55.56 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398633  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.63 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.32 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4789  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.32 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00106132  hitchhiker  0.000000156142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0901  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.79 
 
 
148 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246008  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03857  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  46.58 
 
 
154 aa  151  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.32 
 
 
155 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4431  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.11 
 
 
148 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.722423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.08 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.32 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0976  molybdopterin converting factor, subunit 2  49.68 
 
 
164 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2919  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  50.68 
 
 
151 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  51.37 
 
 
156 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1090  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.68 
 
 
164 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>