More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1712 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  99.14 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  89.27 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  90.56 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  90.56 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  89.27 
 
 		 233 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  87.12 
 
 		 233 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  73.79 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  71.32 
 
 		 276 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  71.32 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  77.09 
 
 		 231 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  76.65 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  76.65 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  76.65 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  76.65 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  68.7 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  68.66 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  66.52 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  57.34 
 
 		 230 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  58.26 
 
 		 224 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  58.26 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  42.78 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  46.7 
 
 		 192 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.73 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  40.3 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  36.63 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  35.08 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  35.08 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38.5 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  42.69 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.86 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.19 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.19 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  35.63 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  28.95 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.19 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.19 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.02 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  32.57 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  33.17 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  33.17 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.34 
 
 		 225 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  32.18 
 
 		 352 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.47 
 
 		 222 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.17 
 
 		 225 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.17 
 
 		 225 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 225 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.38 
 
 		 225 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.17 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.17 
 
 		 225 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.17 
 
 		 225 aa  99  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  27.93 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  31.91 
 
 		 560 aa  97.8  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.29 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  39.2 
 
 		 197 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 		 216 aa  96.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  38.81 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  32.74 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  31.53 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  32 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.16 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  38.31 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  38.31 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.42 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  33.33 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  32.16 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  32.37 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  38.69 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 364 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  31.19 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  31.19 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  38.14 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  36.67 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  38.46 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  32.2 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  32.02 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.6 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 381 aa  92  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  29.67 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  30.1 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  29.67 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 227 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  27.6 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.59 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>