219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1700 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  93.28 
 
 		 402 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  94.17 
 
 		 412 aa  779    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  93.28 
 
 		 402 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 411 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  93.28 
 
 		 402 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5686  glycosyltransferase, MGT family  45.43 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  25.49 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  35.47 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  30.96 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  28.17 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3469  glycosyltransferase, MGT family  30.41 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704679  normal  0.0156932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  23.34 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3139  glycosyl transferase  23.57 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.924253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  21.92 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3722  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  27.14 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  23.95 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  26.84 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  23.44 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  22.52 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  26.3 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  22.41 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  23.4 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  23.4 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  21.78 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  22.66 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  22.72 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  23.21 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  22.72 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  22.72 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  22.72 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 433 aa  89.7  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  26.75 
 
 		 389 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  28.34 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  21.29 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  25.71 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  27.44 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5029  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2408  glycosyltransferase family 28 protein  24.34 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.14 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3265  glycosyltransferase, MGT family  27.2 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  40.71 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2382  glycosyl transferase  21.26 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2655  putative glycosyl transferase  21.26 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000652274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2662  glycosyl transferase  21.2 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2664  glycosyl transferase, putative  21.65 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2421  glycosyl transferase  21.01 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0361033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  21.08 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2662  glycosyl transferase  21.45 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3579  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00269686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2458  glycosyl transferase  21.01 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.091231  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  24.32 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  28.91 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.57 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  28.99 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2638  glycosyl transferase  20.69 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3570  glycosyltransferase, MGT family  24.94 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0172667  normal  0.0986761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  29.19 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1381  glycosyltransferase, MGT family  29.64 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0109047  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  26.29 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  28.67 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1629  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.13 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12976  glycosyl transferase  28.38 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  29.15 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  37.68 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  27.93 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.56 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>