30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1699 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  92.31 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  91.4 
 
 		 229 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  91.4 
 
 		 229 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  91.86 
 
 		 221 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  41.63 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  43.78 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  41.1 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  39.13 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  41.96 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  39.91 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  36.73 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  40.18 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  42.03 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  40.58 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  37.39 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  35.53 
 
 		 255 aa  158  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  38.03 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  40.91 
 
 		 254 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  31.25 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  31.22 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  31.02 
 
 		 170 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  30.48 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  31.02 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  29.73 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  29.73 
 
 		 166 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  26.92 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>