More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1626 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  87.46 
 
 		 327 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  87.16 
 
 		 327 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  87.16 
 
 		 327 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  87.16 
 
 		 327 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  51.52 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.85 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.4 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  34.11 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  34.26 
 
 		 273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  32.62 
 
 		 781 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 621 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1911 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  34.5 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  31.9 
 
 		 852 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  36.24 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.69 
 
 		 742 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  32.7 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  40.94 
 
 		 1392 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.75 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.8 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.96 
 
 		 826 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 861 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.17 
 
 		 439 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.17 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  31.95 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  31.98 
 
 		 289 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  30.41 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.91 
 
 		 751 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  33.48 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 616 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  33.18 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.05 
 
 		 862 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  40.49 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.28 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.74 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 698 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  37.32 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  38.07 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  31.3 
 
 		 877 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  38.07 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  35.98 
 
 		 1007 aa  82.8  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 882 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  36.59 
 
 		 1049 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.27 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.22 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.21 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.48 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.72 
 
 		 820 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 1818 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.88 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  30.4 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  33.03 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  28.74 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  41.54 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  28.74 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.22 
 
 		 929 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1581 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  28.74 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  30.8 
 
 		 802 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  31.84 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  28.98 
 
 		 668 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 617 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 593 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.71 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.78 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1080 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  28.46 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  30.26 
 
 		 664 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1196 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  35.59 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.34 
 
 		 1104 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1492 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  37.5 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.5 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  29.33 
 
 		 957 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  36.09 
 
 		 1053 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  31.05 
 
 		 636 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.16 
 
 		 586 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  35.47 
 
 		 960 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 		 554 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.24 
 
 		 616 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  31.51 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>