102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1531 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  94.97 
 
 		 335 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  95.27 
 
 		 335 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 		 339 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  95.27 
 
 		 335 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  94.55 
 
 		 336 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  94.97 
 
 		 335 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  99.12 
 
 		 339 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  81.55 
 
 		 340 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  83.28 
 
 		 344 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  82.2 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  82.2 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  82.23 
 
 		 363 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  82.2 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  83.49 
 
 		 333 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  82.3 
 
 		 343 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  83.49 
 
 		 333 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  81.9 
 
 		 338 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  83.49 
 
 		 333 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  62.97 
 
 		 328 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  56.61 
 
 		 320 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  56.86 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  60.14 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  56.19 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  54.52 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  55.03 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  48.29 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  54.78 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  53.05 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.66 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.63 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.63 
 
 		 345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.73 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  45.65 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  41.28 
 
 		 798 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.2 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  41.75 
 
 		 1870 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  41.75 
 
 		 1870 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  46.62 
 
 		 362 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  41.46 
 
 		 2997 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.57 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.23 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.53 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  43.21 
 
 		 4502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  38.44 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  44.07 
 
 		 3404 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.4 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  41.1 
 
 		 3432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  41.84 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  41.69 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  43.46 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.29 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  40.26 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  37.5 
 
 		 3207 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  40 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  39.68 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  39.23 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  38.14 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.43 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.27 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  36.33 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.01 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.01 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.72 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.72 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.91 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  36.25 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.46 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  36.1 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.1 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.1 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.1 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.1 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  35.97 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.3 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  25.97 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  25.67 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  27.57 
 
 		 486 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  29.77 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  30.17 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  27.37 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  28.07 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  28.07 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  28.07 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  28.07 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  28.07 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  24.64 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  22.52 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  22.19 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  25.55 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  28.66 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  24.61 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  27.22 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.15 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37038  predicted protein  24.71 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>