More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1518 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  98.35 
 
 
425 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  91.98 
 
 
400 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  90.5 
 
 
420 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  84.56 
 
 
412 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  90.02 
 
 
421 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  100 
 
 
425 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  90.02 
 
 
421 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  56.3 
 
 
512 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  58.78 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  58.47 
 
 
471 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  55.08 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  66.56 
 
 
470 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  66.56 
 
 
509 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  45.14 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  45.27 
 
 
345 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  45.99 
 
 
457 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  45.99 
 
 
457 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  45.27 
 
 
457 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  45.49 
 
 
450 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.52 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.52 
 
 
454 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.19 
 
 
438 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  40.31 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.5 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  36.81 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.18 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36 
 
 
457 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  40.33 
 
 
464 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.86 
 
 
491 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.63 
 
 
448 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.39 
 
 
465 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  33.08 
 
 
441 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  37.16 
 
 
446 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  34.8 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.26 
 
 
464 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  35.59 
 
 
460 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  41.63 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  40.82 
 
 
577 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  42.36 
 
 
385 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  41.88 
 
 
577 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.93 
 
 
475 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  39.5 
 
 
457 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.15 
 
 
472 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.4 
 
 
480 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.93 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  32.28 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32.28 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32.28 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  31.23 
 
 
474 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  38.11 
 
 
470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.33 
 
 
479 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.76 
 
 
503 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  39.52 
 
 
503 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  38.4 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.4 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.01 
 
 
477 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.01 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  42.78 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.76 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  40.43 
 
 
581 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.42 
 
 
471 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  43.72 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.16 
 
 
490 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35 
 
 
471 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.02 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.1 
 
 
468 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  38.95 
 
 
475 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  43.64 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.1 
 
 
447 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.03 
 
 
312 aa  136  8e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  43.64 
 
 
386 aa  136  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  43.03 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  43.9 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  37.5 
 
 
665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  34.44 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.97 
 
 
741 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  37.29 
 
 
695 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  32.08 
 
 
470 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  32.43 
 
 
460 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  39.58 
 
 
656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.25 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  42.68 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.93 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  37.77 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  34.26 
 
 
389 aa  130  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.05 
 
 
465 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  34.11 
 
 
687 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  54.78 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  39.02 
 
 
615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  32.75 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  42.04 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  36.21 
 
 
441 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  50.36 
 
 
225 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  54.76 
 
 
372 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  41.98 
 
 
533 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.02 
 
 
482 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.04 
 
 
692 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  45.27 
 
 
646 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  40.96 
 
 
646 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.97 
 
 
695 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>