More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1403 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  73.65 
 
 		 443 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  75.84 
 
 		 461 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  75.39 
 
 		 441 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  73.65 
 
 		 443 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  78.3 
 
 		 443 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 444 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  73.65 
 
 		 443 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  73.83 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  73.83 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  73.83 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  73.83 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  74.6 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  74.6 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  72.07 
 
 		 443 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  74.6 
 
 		 432 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  69.64 
 
 		 468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  68.92 
 
 		 454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  53.36 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  53.36 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  52.34 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  50.35 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  50 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  49.17 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  45.9 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  47.04 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  44.87 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  44.87 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  40.98 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  40.98 
 
 		 483 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  39.49 
 
 		 422 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  41.06 
 
 		 419 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  39.29 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  37.62 
 
 		 461 aa  252  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  39.11 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  38.21 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  36.6 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.37 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  35.43 
 
 		 490 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  37.59 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  34.17 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  40.35 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  37.06 
 
 		 482 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  34.2 
 
 		 526 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  38.08 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.55 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 487 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  42.7 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  33.5 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.46 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.18 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  35.34 
 
 		 496 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  34.88 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  34.31 
 
 		 499 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 574 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.63 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.63 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.63 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  33.96 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.63 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  34.68 
 
 		 530 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.63 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.63 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 		 517 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.67 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  35.2 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.27 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  31.07 
 
 		 539 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.07 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  34.36 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  32.85 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  32.76 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.75 
 
 		 483 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  32.59 
 
 		 514 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  29.55 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.38 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.19 
 
 		 652 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  41.24 
 
 		 679 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.23 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  40.51 
 
 		 690 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  40.51 
 
 		 690 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  40.51 
 
 		 690 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  38.16 
 
 		 646 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  38.16 
 
 		 642 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  38.16 
 
 		 642 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  40 
 
 		 657 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.97 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  30.71 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  39.62 
 
 		 656 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  36.01 
 
 		 634 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  31.31 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  36.44 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.86 
 
 		 620 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  30.45 
 
 		 494 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  29.02 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>