More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1392 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.69 
 
 
476 aa  945    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.83 
 
 
478 aa  772    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 
478 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.22 
 
 
476 aa  927    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.09 
 
 
474 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 
474 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.39 
 
 
478 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.43 
 
 
476 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.63 
 
 
476 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.04 
 
 
478 aa  773    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.9 
 
 
476 aa  945    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.22 
 
 
476 aa  927    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.16 
 
 
476 aa  955    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  91.37 
 
 
476 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.64 
 
 
476 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.74 
 
 
476 aa  953    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.06 
 
 
478 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.53 
 
 
476 aa  891    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 
474 aa  762    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.59 
 
 
598 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.18 
 
 
496 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.32 
 
 
476 aa  950    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.43 
 
 
476 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.22 
 
 
476 aa  927    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.22 
 
 
476 aa  927    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.32 
 
 
476 aa  950    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.59 
 
 
478 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  96.43 
 
 
476 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.3 
 
 
474 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.39 
 
 
478 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.47 
 
 
475 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.47 
 
 
475 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.16 
 
 
475 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.14 
 
 
476 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.37 
 
 
475 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 
475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.74 
 
 
489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.26 
 
 
475 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.74 
 
 
484 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.75 
 
 
481 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 
475 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.16 
 
 
475 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 
468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0855  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.34 
 
 
483 aa  551  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
478 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.9 
 
 
478 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 
478 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
478 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
478 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.26 
 
 
478 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.9 
 
 
478 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.84 
 
 
478 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.48 
 
 
480 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.09 
 
 
478 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.09 
 
 
478 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.42 
 
 
478 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.21 
 
 
478 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.41 
 
 
473 aa  511  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.2 
 
 
479 aa  504  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.04 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.99 
 
 
477 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.07 
 
 
581 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.65 
 
 
478 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.44 
 
 
478 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.15 
 
 
467 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.1 
 
 
463 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.57 
 
 
468 aa  481  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.12 
 
 
484 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.11 
 
 
467 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 
467 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.9 
 
 
467 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 
467 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 
467 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0268  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.88 
 
 
485 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.27 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.42 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.01 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.01 
 
 
467 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
466 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.73 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.78 
 
 
466 aa  465  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
467 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  52 
 
 
462 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  50.32 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.49 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  51.37 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
467 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
467 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
463 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 
468 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.08 
 
 
466 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  49.68 
 
 
500 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
460 aa  457  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.53 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>