More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1356 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  98.32 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  93.58 
 
 		 298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  93.58 
 
 		 298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  93.58 
 
 		 298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  91.19 
 
 		 298 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  90.54 
 
 		 298 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  69.83 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  73.06 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  67.7 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  73.38 
 
 		 378 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  73.38 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  73.38 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  73.38 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  73.04 
 
 		 421 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  72.64 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  73.04 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  62.89 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  65.08 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  60.34 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 		 289 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  61.81 
 
 		 289 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  62.02 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  52.76 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 626 aa  298  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  55.24 
 
 		 300 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 607 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  53.63 
 
 		 323 aa  295  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  52.67 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  51.6 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  48.81 
 
 		 299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 		 335 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  46.86 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.46 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.59 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 		 319 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  36.84 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  41.34 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.79 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.93 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  32.69 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.26 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.94 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  36.13 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  36.47 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  35.08 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.4 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  37.14 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.1 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  34.96 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  21.85 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  27.13 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.59 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.06 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>