124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1242 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  95.79 
 
 
196 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  95.79 
 
 
196 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  95.79 
 
 
196 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  94.24 
 
 
194 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  86.98 
 
 
197 aa  347  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  80.21 
 
 
201 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  80.21 
 
 
201 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  80.21 
 
 
201 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  75.52 
 
 
194 aa  304  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  73.26 
 
 
189 aa  290  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  73.3 
 
 
192 aa  290  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  72.11 
 
 
198 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  69.27 
 
 
194 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.38 
 
 
192 aa  273  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  71.12 
 
 
195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  67.19 
 
 
194 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  96.97 
 
 
118 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  56.06 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  52.55 
 
 
205 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.89 
 
 
215 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  51.85 
 
 
199 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.27 
 
 
225 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.27 
 
 
193 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  47.15 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.65 
 
 
194 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  45.41 
 
 
194 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  44.15 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  44.57 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  43.48 
 
 
204 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  41.8 
 
 
190 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  41.49 
 
 
189 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  41.49 
 
 
189 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  41.49 
 
 
189 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
189 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  40.43 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.23 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.43 
 
 
189 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.51 
 
 
197 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  27.87 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.56 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.48 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.16 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.62 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  32.16 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.22 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.4 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  29.55 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  26.97 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.7 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.78 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.4 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  28.99 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.4 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.84 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  30.54 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  24.58 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  27.06 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
248 aa  55.1  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 
215 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  29.58 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.32 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.07 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.84 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  25.83 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  24.26 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.45 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  27.5 
 
 
214 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  23.33 
 
 
180 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.99 
 
 
164 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  23.89 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.64 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.83 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.76 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  27.17 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.29 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.68 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  23.66 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  28.39 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.49 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.6 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.28 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.86 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  28.78 
 
 
180 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  30.25 
 
 
430 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>