More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1204 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1231  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
276 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
276 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4462  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  96.74 
 
 
276 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240669  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1301  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  97.1 
 
 
276 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  97.46 
 
 
276 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1319  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  97.46 
 
 
276 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  94.2 
 
 
276 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1713  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  90.94 
 
 
276 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  90.94 
 
 
276 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1513  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  90.58 
 
 
276 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  89.86 
 
 
276 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  90.94 
 
 
297 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  normal  0.172198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1299  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  89.13 
 
 
276 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2837  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  89.45 
 
 
276 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0491533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0787  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0636  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.86 
 
 
341 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0212  Undecaprenyl-diphosphatase  42.38 
 
 
278 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0020  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
280 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434672  normal  0.115672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0723  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.64 
 
 
282 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1821  undecaprenyl-diphosphatase  35.69 
 
 
271 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3761  Bacitracin resistance protein BacA  40.93 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.83 
 
 
264 aa  155  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0925  hypothetical protein  83.7 
 
 
94 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0025  hypothetical protein  83.7 
 
 
94 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0889  hypothetical protein  83.7 
 
 
94 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
266 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.11 
 
 
265 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37 
 
 
264 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  35.53 
 
 
264 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  37.55 
 
 
266 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  37.16 
 
 
258 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.93 
 
 
267 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.11 
 
 
266 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  37.08 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.96 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  36.73 
 
 
265 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  35.71 
 
 
278 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  38.91 
 
 
302 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.85 
 
 
267 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.87 
 
 
266 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  35.23 
 
 
386 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.51 
 
 
265 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  35.47 
 
 
267 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.91 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.69 
 
 
292 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.32 
 
 
266 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0196  Bacitracin resistance protein BacA  35.29 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 
278 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.98 
 
 
261 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.1 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.17 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.21 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.13 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  33.57 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.04 
 
 
266 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.62 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  37.07 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0594  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  37.69 
 
 
270 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.11 
 
 
266 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0738  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6963000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0810  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.3 
 
 
282 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  37.74 
 
 
272 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.3 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.3 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.34 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.33 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  37.45 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0649  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0714  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.38134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  28.26 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0683  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4622  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.71 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0441  bacitracin resistance protein BacA  31.78 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  34.33 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.34 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.27 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  39.08 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.27 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.14 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  36.1 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.27 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.86 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  33.91 
 
 
277 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.86 
 
 
276 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  35.38 
 
 
290 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.58 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.79 
 
 
266 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.27 
 
 
266 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
276 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.43 
 
 
266 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.09 
 
 
278 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>