More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1185 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1537  exopolyphosphatase protein  67.77 
 
 		 527 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  96.43 
 
 		 504 aa  984    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  68.37 
 
 		 510 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  98.02 
 
 		 504 aa  1003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  87.25 
 
 		 535 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  93.65 
 
 		 504 aa  967    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  89.04 
 
 		 509 aa  912    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  67.84 
 
 		 510 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  98.21 
 
 		 504 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 504 aa  1019    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  98.21 
 
 		 504 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  98.02 
 
 		 504 aa  1001    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  99.6 
 
 		 504 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  68.36 
 
 		 512 aa  690    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  68.16 
 
 		 512 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  93.45 
 
 		 504 aa  966    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  88.84 
 
 		 503 aa  906    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  59.77 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  54.29 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  55.08 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  53.66 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  52.42 
 
 		 491 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  48.6 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  44.25 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  46.86 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  43.32 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.17 
 
 		 501 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  44.82 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.77 
 
 		 500 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.57 
 
 		 500 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.97 
 
 		 506 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  42.77 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  41.1 
 
 		 526 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  42.32 
 
 		 501 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  41.4 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  41.16 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2123  Ppx/GppA phosphatase  44.83 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  41.95 
 
 		 499 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  39.6 
 
 		 508 aa  349  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  41.92 
 
 		 500 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  39.01 
 
 		 520 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  40 
 
 		 506 aa  343  5.999999999999999e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  39.36 
 
 		 509 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  38.48 
 
 		 519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  38.48 
 
 		 519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1483  Ppx/GppA phosphatase  43.4 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.899427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2375  Ppx/GppA phosphatase  43.4 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  42.63 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  38.28 
 
 		 519 aa  339  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  40.44 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  44.07 
 
 		 508 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1294  Ppx/GppA phosphatase  41.83 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  42.83 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 526 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 526 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 526 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 526 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  40.8 
 
 		 505 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  38.51 
 
 		 513 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  43.17 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  38.08 
 
 		 516 aa  332  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 513 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  41.55 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  42.83 
 
 		 505 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  38.13 
 
 		 513 aa  329  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  37.42 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  39.6 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  40.68 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  41.85 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  37.83 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  44.47 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  42.2 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  39.22 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  43.34 
 
 		 508 aa  323  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  36.82 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  36.62 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  42.44 
 
 		 506 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.87 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  41.43 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  38.46 
 
 		 501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  36.69 
 
 		 502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.8 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.8 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  37.8 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  39.07 
 
 		 503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>