255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1093 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  94.81 
 
 		 347 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  96.83 
 
 		 347 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  95.68 
 
 		 347 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  95.97 
 
 		 347 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  98.56 
 
 		 347 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 347 aa  703    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  95.97 
 
 		 347 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  87.42 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  86.16 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  86.16 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  78.37 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  70.35 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  70.35 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  64.67 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  64.97 
 
 		 380 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  63.69 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  65.63 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  65.94 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  65.76 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  64.91 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  61.67 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  65.15 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  63.72 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  62.31 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  58.82 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  56.66 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  56.04 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  55.42 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  52.66 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  50.44 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  47.97 
 
 		 337 aa  338  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  47.09 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  49.42 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  48.24 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  45.77 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  46.59 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  46.29 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  46.85 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  46.29 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  48.76 
 
 		 335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  46.29 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 		 336 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  45.13 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  45.85 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  45.86 
 
 		 335 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.25 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  46.27 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  44.97 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  44.57 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  45.96 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  44.69 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  41.71 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.74 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.71 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  40.57 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  41.56 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  37.43 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  41.56 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  44.14 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  39.54 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 355 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  43.98 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 		 347 aa  242  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.25 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  40.88 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.31 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.67 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.47 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  42.9 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.36 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  40.41 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  40.53 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  42.07 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  40.81 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  40.06 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>