More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1092 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.09 
 
 		 550 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.31 
 
 		 565 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  77.37 
 
 		 570 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  77.72 
 
 		 568 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  77.72 
 
 		 570 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.39 
 
 		 558 aa  1038    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  91.46 
 
 		 562 aa  898    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2857  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  81.23 
 
 		 548 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.15 
 
 		 562 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  77.72 
 
 		 570 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.81 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  77.72 
 
 		 570 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 558 aa  1059    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.81 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  77.72 
 
 		 570 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  77.54 
 
 		 570 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.59 
 
 		 565 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  58.05 
 
 		 589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  57.87 
 
 		 589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 		 506 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.27 
 
 		 569 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.47 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.22 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 		 582 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.84 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.62 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.47 
 
 		 542 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.09 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.09 
 
 		 579 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.64 
 
 		 558 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.17 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.61 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.86 
 
 		 548 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.84 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 		 562 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  45.15 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.83 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 		 574 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  44.34 
 
 		 543 aa  363  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 		 528 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 		 559 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.38 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 		 562 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.08 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 		 546 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 		 543 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.87 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 		 544 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  43.72 
 
 		 559 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  38.12 
 
 		 541 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 560 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 560 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 		 543 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 		 544 aa  343  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 		 544 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 		 544 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  36.62 
 
 		 555 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 		 543 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  36.7 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  40.26 
 
 		 543 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 		 543 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 549 aa  333  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 541 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.8 
 
 		 559 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0471935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.48 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.45 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.45 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.94 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 538 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  37.5 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 		 533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 		 552 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 		 544 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  40.07 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  34.71 
 
 		 564 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 541 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 		 543 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>