More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0993 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  100 
 
 
209 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0993  Maf-like protein  100 
 
 
209 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  92.38 
 
 
210 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  92.38 
 
 
210 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  92.38 
 
 
210 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2187  Maf-like protein  92.82 
 
 
209 aa  347  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4229  Maf-like protein  91.9 
 
 
210 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0526  Maf-like protein  82.67 
 
 
215 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1807  Maf-like protein  82.67 
 
 
215 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2484  Maf-like protein  82.67 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2911  Maf-like protein  82.67 
 
 
237 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2796  Maf-like protein  82.67 
 
 
215 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2798  Maf-like protein  82.67 
 
 
215 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2857  Maf-like protein  82.67 
 
 
215 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1713  Maf-like protein  82.67 
 
 
236 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  72.28 
 
 
206 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1068  Maf-like protein  73.27 
 
 
205 aa  273  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2916  Maf-like protein  74.49 
 
 
205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127019  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  69.07 
 
 
199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  70.92 
 
 
194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  68.84 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  68.34 
 
 
198 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  66.49 
 
 
199 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  62.56 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  61.46 
 
 
191 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  58.88 
 
 
219 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  60.7 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  58.46 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  58.42 
 
 
192 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  60.62 
 
 
201 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  60.42 
 
 
193 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  65.1 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  57.51 
 
 
199 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  59.69 
 
 
201 aa  195  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  56.91 
 
 
193 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  52.82 
 
 
199 aa  192  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  61.62 
 
 
199 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5276  maf protein  59.04 
 
 
206 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  61.62 
 
 
199 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  60.21 
 
 
212 aa  188  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  51.83 
 
 
194 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  51.83 
 
 
194 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  51.83 
 
 
194 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  51.83 
 
 
194 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  51.31 
 
 
194 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  54.26 
 
 
198 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  54.5 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3264  maf protein  58.64 
 
 
199 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  46.46 
 
 
196 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  50.52 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  57.67 
 
 
189 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  49.47 
 
 
203 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  51.08 
 
 
194 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  50.26 
 
 
194 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  56.99 
 
 
191 aa  174  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  49.74 
 
 
204 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  48.42 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  45.92 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  48.95 
 
 
194 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  48.95 
 
 
194 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  48.95 
 
 
207 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  44.56 
 
 
193 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  51.31 
 
 
202 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  53.97 
 
 
206 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  53.97 
 
 
201 aa  168  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  46.11 
 
 
194 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  45.6 
 
 
194 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  47.37 
 
 
204 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  48.15 
 
 
194 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  46.56 
 
 
193 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  46.56 
 
 
195 aa  164  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2007  maf protein  48.68 
 
 
199 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  46.84 
 
 
198 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  46.84 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  48.15 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  46.84 
 
 
198 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  44.04 
 
 
200 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2299  maf protein  47.72 
 
 
206 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  43.39 
 
 
193 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.7 
 
 
197 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  48.42 
 
 
204 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  48.42 
 
 
197 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  42.63 
 
 
200 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  48.19 
 
 
192 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  48.19 
 
 
192 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1986  septum formation protein Maf  46.63 
 
 
199 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000287921  hitchhiker  0.00293125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  44.27 
 
 
206 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  49.74 
 
 
193 aa  151  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  47.87 
 
 
204 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  42.71 
 
 
200 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  43.09 
 
 
193 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>