More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0938 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
249 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
249 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  97.99 
 
 
249 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  97.99 
 
 
249 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  97.99 
 
 
249 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  96.79 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  97.59 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  95.98 
 
 
249 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  94.38 
 
 
249 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  91.97 
 
 
249 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  93.17 
 
 
249 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  91.97 
 
 
249 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  90.76 
 
 
249 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  90.76 
 
 
249 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0250  electron transfer flavoprotein subunit beta EtfB  90.76 
 
 
249 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  85.54 
 
 
267 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  85.14 
 
 
249 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  85.14 
 
 
249 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  85.14 
 
 
249 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  85.54 
 
 
249 aa  417  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  85.14 
 
 
249 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  86.35 
 
 
249 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  85.14 
 
 
249 aa  417  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  84.74 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  83.13 
 
 
249 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  83.53 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  84.74 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  85.14 
 
 
249 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  82.33 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  83.94 
 
 
249 aa  410  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  81.93 
 
 
249 aa  411  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.53 
 
 
249 aa  410  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.93 
 
 
249 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  82.33 
 
 
249 aa  410  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  83.94 
 
 
249 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  81.93 
 
 
249 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  84.34 
 
 
249 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  82.73 
 
 
249 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1465  electron transfer flavoprotein subunit beta  90.36 
 
 
249 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135999  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  82.73 
 
 
249 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  83.13 
 
 
249 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  81.93 
 
 
249 aa  404  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3570  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  83.53 
 
 
249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  80.32 
 
 
249 aa  400  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  80.72 
 
 
249 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  80.72 
 
 
249 aa  400  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.92 
 
 
249 aa  400  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.71 
 
 
249 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  76.71 
 
 
249 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  79.52 
 
 
249 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.31 
 
 
249 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  74.7 
 
 
249 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  74.3 
 
 
249 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.49 
 
 
249 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  363  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  74.9 
 
 
249 aa  362  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 
249 aa  362  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  362  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.9 
 
 
249 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  71.49 
 
 
251 aa  359  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.49 
 
 
249 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.49 
 
 
249 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.49 
 
 
249 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  74.07 
 
 
249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.49 
 
 
249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.29 
 
 
249 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.9 
 
 
249 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  73.09 
 
 
256 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  72.29 
 
 
249 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.69 
 
 
249 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  72.69 
 
 
249 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  71.49 
 
 
249 aa  352  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.14 
 
 
248 aa  352  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.29 
 
 
249 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.08 
 
 
249 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  70.28 
 
 
249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 
249 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  70.68 
 
 
249 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6347  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  90.82 
 
 
207 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.88 
 
 
446 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.92 
 
 
248 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  69.92 
 
 
248 aa  348  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.89 
 
 
249 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  73.9 
 
 
249 aa  347  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3854  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  347  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445723  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9247  electron transfer flavoprotein beta subunit  72.69 
 
 
249 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0111601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.49 
 
 
249 aa  345  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>